分类： 基因组测序
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西瓜属泛基因组揭示西瓜的进化和驯化历程

期刊：Plant Biotechnologe Journal

IF：13.8

时间：2023年8月

全文：http://www.biomarker.com.cn/wp-content/uploads/2023/08/plant-biotechnology-journal-2023-.pdf

该研究首先以3份野生西瓜种为材料组装基因组，随后结合已发表3个西瓜基因组进行比较基因组分析，发现野生西瓜和栽培西瓜间存在较大的染色体间重排，并基于共线性区块推测了西瓜的分化关系。接着，对201份野生西瓜进行了重测序，并结合已有重测序数据对547份西瓜材料进行泛基因组构建，并基于该泛基因组鉴定到了栽培西瓜在驯化过程中受选择的关键基因，例如调节西瓜果肉中的糖积累的糖转运蛋白ClTST2基因。

牛筋草高质量基因组揭示草甘磷靶基因复增新机制

期刊：Nature Communications

IF：16.600

时间：2023年7月

全文：http://www.biomarker.com.cn/wp-content/uploads/2023/08/2023-nc-.pdf

该研究首先构建了草甘膦敏感和草甘膦抗性牛筋草高质量基因组，并基于该基因组和重测序数据将草甘膦靶基因EPSPS定位于3号染色体上。进一步研究发现，在草甘膦抗性牛筋草中，EPSPS基因与其它几个基因融合后形成复增片段插入到基因组的一个或多个亚端粒区域，而非单基因复增。此外，由于牛筋草染色体亚端粒区序列高度重复，功能基因较少，从而使牛筋草以较小的代价获得新抗性，促进抗性种群快速进化。

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