真菌精细图（ONT）

答：具体的组装方法有三种，选择最优的组装结果。

方法一：二代数据和三代数据测序片段混合组装；

方法二：二代数据和三代数据分别组装，然后再用分别组装后的结果在congtig水平再连接组装；

方法三：二代数据组装，再用三代数据对二代组装的contig进行连接到scaffold水平。

答：真菌基因组准完成图是通过二代测序+三代测序+光学图谱结合进行组装分析，将真菌基因组组装到近染色体的水平，组装到近染色体不是说通过光学把组装的scaffold挂到染色体上，意思是组装出来的scaffold数量接近染色体的数量，是组装完整性的一种指标。

答：对于真菌基因组测序，首先注意保证不要有杂菌的污染，需要通过核染色确定真菌基因组是单核还是多核，可通过细菌基因组调研图来确定杂合度以及重复序列，再评估最佳的精细图测序策略。