单细胞免疫组库

免疫组库（Immune Repertoire，IR）是B/T淋巴细胞抗原受体多样性检测，即BCR/TCR的多样性。BCR和TCR一般由可变区(V区)、多变区(D区)、连接区(J区)、恒定区(C区)构成, V(D)J区域在遗传过程中发生重排或重组，形成大量不同的组合形式，导致BCR和TCR基因序列多样性极其丰富，这些序列多样性集合称为免疫组库。

单细胞免疫组库测序（scVDJ-seq ）是基于10x Genomics平台的微流控和油滴包裹技术，在单细胞水平同时检测转录组基因表达和TCR/BCR多样性，不但可以了解TCR/BCR克隆型，还可以联合转录组数据深入挖掘生命机理，为免疫组学研究提供更高效的平台，在肿瘤微环境、感染性疾病、自身免疫疾病等研究领域有着广泛的应用前景。

利用10× Genomics平台完成单细胞的分离、反转录成cDNA后，将cDNA一分为二，同时进行TCR/BCR的V(D)J建库和5’单细胞转录本建库，并连接测序引物，获得每个细胞5’基因表达数据和V(D)J全长序列信息，获得数据进行细胞亚群聚类、细胞表达特征、标记分子筛选、免疫组库克隆型等分析。

百迈客推出10x genomics 单细胞免疫组库升级版2.0，使用chipK芯片和dual index，全新体验，性能更优。

乳腺肿瘤微环境中多种免疫表型的单细胞图谱

了解肿瘤微环境中免疫细胞的表型，对于癌症进展和免疫治疗反应的研究至关重要。研究者使用单细胞RNA测序分析了来自8位原发性乳腺癌患者的45,000个免疫细胞，观察到正常免疫细胞与肿瘤组织中免疫细胞之间有显著相似性，但后者针对肿瘤微环境出现特异性连续表型扩展；并通过单细胞免疫组库测序检测另外27,000个T细胞转录组基因表达和T细胞受体（TCR）多样性，结果揭示了TCR组合使用对表型多样性的影响。单细胞免疫组库和单细胞RNA数据联合分析更有利于研究肿瘤微环境、寻找免疫治疗的靶点，辅助肿瘤诊疗。