常规的相对丰度分析忽略了不同样本之间总体微生物量存在的现实差异,造成了分析结果的偏差。而绝对定量分析则是计量样本每种微生物的16S基因拷贝数或者细胞数目,从而实现绝对定量,因此相对于常规16S相对定量扩增子测序,绝对定量分析能反映样本每种微生物的真实数量和组间样本的真实差异。
百迈客运用高通量测序技术和spike-in内标法实现对细菌的绝对定量。通过在样品中加入已知拷贝数的spike-in内参序列,与样品同时进行扩增、建库测序,然后通过内参的理论拷贝数与测序tags数,绘制标准曲线,结合标准曲线及样品的组织、核酸、扩增用量等计算得到OTUs/ASVs的绝对拷贝数表。能够一次获得所有细菌的绝对定量结果,包括总丰度和每种菌的丰度。
产品类型 | 支持区域 | 数据量 | 分析内容 |
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细菌绝对定量(三代) | 16S全长 | 1W CCS | 常规扩增子分析+绝对定量 |
细菌绝对定量(二代) | 16S V3-V4,16S V4 | 5W tags | 常规扩增子分析+绝对定量 |
组织类型 | 送样量 |
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土壤 | 1~2g |
粪便 | 0.5~2g |
备注:上述组织送样量均为三次提取的量