T2T基因组(Telomere-to-Telomere),即端粒至端粒的完整基因组组装的简称,是更完整基因组的代表。T2T基因组主要是通过多种测序平台、高深度测序,结合多种软件方式来获得具有端粒与着丝粒的的gap-free或gap-less的高质量基因组。端粒为真核生物染色体末端的一种特殊结构,由 DNA重复序列和特异结合蛋白组成的复合体。高等生物的着丝粒由数千个高度重复单元串联形成。而这些重复区域高度复杂,是三代测序与组装中的难点,也是T2T基因组重点攻克对象。T2T基因组的构建将进一步助力物种基因组中复杂区域的解析,尤其是早期难以被破解的“黑色领域”,可为物种的深度研究提供重要的基础信息。
可以获得高准确性、高连续性、高完整性的端粒到端粒的高质量基因组
可以克服着丝粒和高重复区域的组装难题
可以克服着丝粒和高重复区域的组装难题
探索染色体的起源, 驯化以及鉴定性别关键基因
测序类型 |
完成周期 |
组装指标 |
测序深度 |
文库大小 |
PacBio HiFi | 3-6个月(组装注释)
(视物种具体情况而定) |
至少一条染色体达到T2T
(视物种具体情况而定) |
基因组≥60x | 15-20kb |
ONT Ultra-long | 基因组≥40x | 50kb/100kb/150kb |