T2T基因组

从端粒到端粒的gapfree/gapless基因组

技术介绍

T2T基因组(Telomere-to-Telomere),即端粒至端粒的完整基因组组装的简称,是更完整基因组的代表。T2T基因组主要是通过多种测序平台、高深度测序,结合多种软件方式来获得具有端粒与着丝粒的的gap-free或gap-less的高质量基因组。端粒为真核生物染色体末端的一种特殊结构,由 DNA重复序列和特异结合蛋白组成的复合体。高等生物的着丝粒由数千个高度重复单元串联形成。而这些重复区域高度复杂,是三代测序与组装中的难点,也是T2T基因组重点攻克对象。T2T基因组的构建将进一步助力物种基因组中复杂区域的解析,尤其是早期难以被破解的“黑色领域”,可为物种的深度研究提供重要的基础信息。

T2T基因组解析高度复杂区域 Gladman N et al., Current Opinion in Biotechnology, 2023

技术特点

  • 可以获得高准确性、高连续性、高完整性的端粒到端粒的高质量基因组

  • 可以克服着丝粒和高重复区域的组装难题

  • 可以克服着丝粒和高重复区域的组装难题

  • 探索染色体的起源, 驯化以及鉴定性别关键基因

技术路线

T2T基因组技术路线

测序策略

测序类型

完成周期

组装指标

测序深度

文库大小

PacBio HiFi 3-6个月(组装注释)

(视物种具体情况而定)

至少一条染色体达到T2T

(视物种具体情况而定)

基因组≥60x 15-20kb
ONT Ultra-long 基因组≥40x 50kb/100kb/150kb

结果展示

家鸡T2T基因组组装 (Huang Z et al., PNAS, 2023)
西瓜G42 T2T基因组与97103v2基因组共线性分析 (Deng Y et al., Molecular Plant, 2020)

百迈客生物服务优势

同时具备主流三代测序平台PacBio与Nanopore,通量充足,测序模式随心选

多年基因组组装项目经验,专业的个性化分析团队,T2T基因组可轻松应对

基因组成功案例200+,影响因子2000+

实验与生信分析,软著+专利双重加持

合作案例文献

百迈客生物服务流程

  • 样品寄送

  • 建库测序

  • 数据分析

  • 出具报告

  • 售后答疑