分类: 时空组学

白驹过隙,时光荏苒。2022年百迈客突破国外技术垄断,推出百创系列产品,提供植物单细胞测序新方案,打造单细胞&空间个性化交互式分析,成功助力蝴蝶兰花器官时空图谱国内首秀,积累了丰富的项目经验。接下来,让我们一起来看看今年百迈客在单细胞&空间组学上有哪些突破。

百创智造,破界而出

百创DG1000突破直径壁垒:为了突破单细胞试剂耗材及仪器长期以来的国外技术垄断,降低单细胞应用的成本,突破主流平台40μm细胞直径限制,满足更多的单细胞场景需求。经过潜心研发,百迈客发布了自主研发的单细胞微液滴系统-百创DG1000。

百创DG1000单细胞微液滴系统

百创DG1000单细胞微液滴系统

百创S1000亚细胞级分辨率:今年由百创智造推出亚细胞级别空间转录组测序技术,不仅打破了国外芯片技术的垄断,还突破了分辨率和检测通量的局限,支持100μm ~5μm多级分辨率分析。成为“亚细胞级分辨率”和“微孔”结合的原位捕获空间转录组测序技术,全面迈入国产化空间转录组的亚细胞技术时代。

百创S1000局部多级分辨率可视化

百创S1000动态多级分辨率展示

百创S1000-Nanopore空间全长转录组:今年百创智造发布了百创S1000-Nanopore空间全长转录组产品。经过不断研发测试,百创S1000不仅解决了分辨率低、成本高等难题,其独立设计的SpatialBarcode还可以高度适配ONT平台,获得的有效数据量得到了大幅提高,为广大科研人员和临床工作者开展发育、肿瘤、免疫、神经等一系列研究和应用提供了新思路。

多种方案,随心挑选

百迈客植物单细胞核转录组技术(snRNA-seq),无需进行原生质体的制备,在保证高效捕获分选单细胞核转录组数据的同时,减少了应激基因表达影响、胞质内代谢物的干扰,并可兼容更大细胞直径,获得更全面信息。也为特殊样本进行单细胞测序提供了新的解决方案,为进一步推动植物单细胞研究提供重要的技术支撑。

不同植物样本抽核效果展示

植物单细胞核项目实例数据

个性化云交互,自主探索更多可能

百迈客研发团队全力打造的单细胞&空间转录组个性化交互平台,专为解决广大客户的个性化分析问题而生,分析参数随心更改、分析不限次数,省时省力,高效完成交互式分析。

单细胞个性化交互云平台

可自主进行细胞过滤、细胞聚类、maker基因分析、细胞注释、差异分析等交互式分析。

空间转录组交互式云平台

可自主进行spot数据过滤、多样本整合分析、降维聚类分析、基于目标区域的差异基因分析等步骤。

交互式软件,便于可视化分析

百迈客自主研发的多级分辨率可视化工具–Spatial Tools,该工具可以进行自定义展示HE图、全局聚类图、目标cluster聚类图、单细胞联合空间细胞类型注释分布图。针对感兴趣的区域,可以使用选框或套索工具获取目标区域的barcode列表,自定义配色、透明度、标题、图例调整等,分析内容更加贴近实际所需,交互式功能十分强大。

助力蝴蝶兰时空图谱国内首秀

影响因子:19.160

发表单位:复旦大学与江西农业大学

百迈客提供服务:10x Visium空间转录组技术

研究内容:利用10x Visium空间转录组学数据分析了蝴蝶兰花器官早期发育过程中基因表达的动态变化。通过对时空表达分布的比较,确定了在特定组织/阶段优先表达的数千个基因,包括MADS-box基因和许多其他潜在下游基因,形成了花器官初始化、身份决定和形态建成的模型。对兰花开花发育过程进行了系统的研究,为进一步研究兰花开花过程中复杂而重要的基因调控网络提供了宝贵的资源。

百迈客项目经验分享

 目前百迈客单细胞转录组已完成动植物物种50+类,组织类型250+种。空间转录组已在100余种不同物种组织类型中得到验证,突破了软骨、血管、皮肤、花苞、幼芽等疑难样本切片透化的难点攻克,积累了丰富的项目经验。

百迈客单细胞(核)转录组数据质量稳定

百迈客空间转录组数据质量优异

尾声

凡是过往,皆为序章。直挂云帆,乘风破浪。2023我们将砥砺前行,共话新篇章!

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