群体遗传分析平台有哪些？BSA/遗传图谱/GWAS/遗传进化云平台推荐

群体遗传分析平台推荐1、全基因组重测序分析平台

全基因组重测序是对已知基因组序列的物种进行不同个体的二代或三代基因组测序，并在此基础上对个体或者群体进行变异检测分析。利用百迈客全基因组重测序分析云平台，只需要上传原始data，打开主流程APP，即可完成从原始数据到结题报告的转化。不仅可以下载结果，而且可以在云平台上面做云个性化分析，不仅可以在线查看位点SNP、InDel、SV、CNV等信息，还可以支持设计引物、进化树分析等功能。

群体遗传分析平台推荐2、BSA分析平台

BSA（Bulked segregant analysis）作为一种快速的性状定位分析方法，可以极大地降低研究的工作量和成本，该方法主要是选择双亲群体分离后代中具有极端表型的个体进行混样，通过比较不同极端混样池之间的多态性标记的差异，从而筛选出与性状相关的分子标记，实现目标基因的定位。百迈客BSA分析云平台现已正式实现云交付，可以提供BSA分析云服务，实现原始数据一步上传，分析参数自主设置，除此之外，BSA分析云平台还提供常见个性化分析等服务。将助力BSA成为更快速、更低价、性价比更高的性状定位分析！

群体遗传分析平台推荐3、全基因组关联分析平台

全基因组关联分析（Genome wide association study，GWAS）是对多个个体在全基因组范围的遗传变异（标记）多态性进行检测，获得基因型，进而将基因型与可观测的性状，即表型，进行群体水平的统计学分析，根据统计量或显著性p 值筛选出最有可能影响该性状的遗传变异（标记），挖掘与性状变异相关的基因。全基因组关联分析云平台只需要提供常规的基因型文件（VCF文件）和需要分析的表型数据，即可得到多个模型的定位结果。APP中自嵌合了亲缘关系分析，群体结构（固定效应）、场次、性别、批次等因素可以通过协方差文件传入。即可拿到分析的曼哈顿图和QQ图，以及对应的注释区间。

群体遗传分析平台推荐4、遗传进化分析平台

群体遗传进化是研究群体的遗传结构及其变化规律。其应用数学和统计学方法研究群体中基因频率和基因型频率以及影响这些频率的选择效应和突变作用，研究迁移和遗传漂变等与遗传结构的关系。该分析平台目前只需要提供基因型文件（VCF格式）和分组信息。即可完成遗传进化分析。系统进化树、PCA、遗传多样性分析、群体结构、亲缘关系、LD、选择性清除等即可一键获得结果文件。

群体遗传分析平台推荐5、遗传图谱分析平台

遗传图谱（Genetic map），是基于全基因组重测序技术或简化基因组测序技术，对某物种家系样本进行测序，利用生物信息学方法，开发SNP分子标记，计算标记间的遗传连锁距离，绘制高密度遗传图谱。利用遗传图谱，可以用来进行性状QTL定位。该分析平台，可以可轻松实现遗传图谱的构建。

目前百迈客群体遗传相关项目已经实现了云交付。百迈客云分析平台整合了目前最主流的分析流程，结果准确有保证，分析过程简单易上手，从数据上传到参数设置，再到基因组选择，只需简单几步就可以完成项目数据的投递和分析；结题报告云交付，分析完成即可拿到项目结果。
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百迈客自成立以来，深耕群体遗传研究领域，在群体遗传进化及性状定位方面积累了大量的项目经验，研究物种数百种，定位性状上万个，发表文章数百篇，累计影响因子2300+；极大促进了我国群体遗传研究的发展。

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