分类： 医学研究
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装R包有时候会遇到特别难装的，费时费精力。主要是无从下手。下面就全面的解决下这个问题。
一、解决问题的思路：

1.包可能存在依赖包，缺啥装啥，直到装成功。

2.多种方法尝试。尝试的顺序可以由简到繁。

二、解决问题的方法：

1.从相同系统的电脑上拷过来相应的包（位于library路径下面），然后library()这个包判断是否安装成功（大部分会成功）。如果没有或者没安装成功只能用其他方法自己辛苦安装了。

2.install.packages()

3. BiocManager::install()

4. conda

5. devtools::install_github()

6.下载源码用install.packages(“xxxx.tar.gz”,repo=NULL,type=”source”)安装

linux的话，在启动R的交互界面之前或者使用conda之前需要激活这个R处的环境，否则在交互界面安装R包的过程中可能会找不到编译器而报错。激活方法参考：source activate /yourpath/miniconda3/envs/R-4-0-3

具体示例如下：

比如我要装Cairo这个包

我首先尝试用install.packages(“Cairo”)安装。报错了，报错信息如下：

然后用BiocManager::install(“Cairo”)来安装。首先要安装BiocManager(方法：install.packages(“BiocManager”))。这个方法也没安装成功。

然后尝试conda install -c conda-forge r-cairo（注意包的名字用小写字母）来安装。出来这个敲y，一般都能安装成功。conda安装R包首先要安装有conda，然后激活conda环境，在命令行而不是交互界面去安装。

最终安装成功的界面：

可以在R的交互界面上用library(Cairo)看下是否装成功。

另外两种安装包的方法示例如下：

方法5 devtools::install_github()
devtools::install_github() 从github（网址：https://github.com/）上查找包隶属于哪个，用于写在括号里，再安装，方法如下：

方法6源码安装：

当报错，有下载包不完整的情况，可以把这个路径的包先下载下来再安装。安装的时候如果遇到相关的包没装，再用这几种方法从简到繁装上，然后再装这个包。

linux上下载方法：

wget -c https://bioconductor.org/packages/3.12/bioc/src/contrib/DOSE_3.16.0.tar.gz 把包的源码下载下来

然后在R的交互界面用：install.packages(“xxxx.tar.gz”,repo=NULL,type=”source”)安装

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