CircRNA是真核生物中共价封闭的内源性生物分子，具有组织特异性和细胞特异性的表达特点。其来源方式多样，不易受RNA外切酶影响,表达更稳定,不易降解，许多circRNA可通过充当microRNA的“海绵”或某些蛋白质的抑制剂，从而阻断miRNA对靶基因的抑制作用，同时调控其他类型RNA的表达，circRNA一直是科研人员关注的热点研究之一，并且随着CircRNA的编码能力的发现，circRNA的研究更是吸引了大家的目光。
近期，Nature发表了一篇关于真核生物中的CircRNA研究发展的评论（Widespread occurrence of circular RNA in eukaryotes），文章中介绍了从在20世纪70年代末到当前CircRNA的主要发展节点，从80年代，CircRNAs被认为起源于RNAs的副产物，到2013年，《自然》杂志同一期的两篇文章报道了真核生物中数千个含有外显子序列的CircRNAs，再到Memczak和Rajewsky等人的论文揭示了CircRNA参与的复杂调控网络，CircRNA的研究一直在如火如荼的进行中。据不完全统计，仅2020年已发表的circRNA相关文章，影响因子大于10的文章有99篇，5~10的文章有324篇，小于5的文章1468篇！特别是影响因子>10的CircRNA文章数量相比之前的五年有明显增长。
百迈客生物作为国内转录组学研究的先行者，不仅对于线性RNA的研究经验丰富，在非编码RNA的研究方向上也身经百战，涉及覆盖动物、植物、真菌等近百个物种类型，为了方便客户的数据挖掘，同时也配备了专业完善的分析平台，今天就要向各位宣布一个好消息，CircRNA的个性化上线啦！
一、基因查找不费劲
CircRNA的功能分析主要依靠于来源基因的功能注释，如何在海量的数据中直接找到关心的目的基因呢?首先就是根据功能注释进行检索，百迈客云平台的CircRNA分析平台中，支持针对结果根据八大功能数据库的注释信息批量检索相关注释基因、并且批量提取相关信息；靶向关系的预测也是关键circRNA检索的必要一步，CircRNA分析平台同时支持通过miRNA的ID批量提取相关靶向的CircRNA信息，此外，CircRNA ID、来源基因ID、来源基因name等功能，通过上传ID文件均可实现批量查询，甚至可以批量下载序列文件，省去多个文件来回切换的繁杂操作，一键式提取关键信息！
二、功能注释富集分析信手拈来
CircRNA的调控作用深度挖掘离不开功能富集分析，研究角度的多样、筛选条件的调整直接导致图形绘制的重复工作量，为了让老师们不再为美观多样的富集图绘制而感到头秃，CircRNA云平台支持多种富集图在线绘制，无需整理复杂多样的输入文件，无需学习晦涩难懂的生信语言，无论怎么调整基因集合，只需要一个点击，美观准确的八大类型富集图即刻获得！（配合基因筛选功能使用更佳哦~）
三、差异参数任性调整
对于需要通过结果分析挑选关键基因的研究方向来说，选择合适的差异筛选条件对于基因的选择是事半功倍的，但是往往合适的筛选条件需要多次的调整摸索，这时差异筛选条件的调整功能显得尤为重要，CircRNA云平台同样支持在线完成差异参数的调整，基因数目太少、差异软件不合适、参数设置不合理等问题，通通可以调整！不限次、不限时，只需简单的点击，轻松完成！
四、多个分组轻松比较
单一变量下的差异比较组结果往往无法证明相应结论，所以往往会设置多个比较组，当有多个差异比较组时，如何轻松筛选在各个集合间不同表达模式的基因显得尤为重要，此时，韦恩图扮演了重要的角色，通过不同比较组基因集合的韦恩图，我们可以轻松获得在任意比较组中特意表达或者在各个组合中共同表达的基因集合，CircRNA分析平台分别配有基因表达韦恩图（筛选不同样本中特有或者共有表达基因集）以及差异表达韦恩图（筛选不同差异分组中特有或者共有表达基因集），进一步配合上下调基因的筛选，轻松找出有连续变化模式的基因集（这些基因可能是性状相关的关键基因哦~
五、共表达分析助力数据挖掘
共表达分析常用于识别差异表达基因的共表达模式，分析各样品间CircRNA表达丰度的不同变化模式，将相同表达趋势的CircRNA划分为一个数据集，通常我们认为，具有相同表达变化趋势的基因的功能互有关联，所以通过分析CircRNA的共表达趋势分析，可以进一步筛选出项目中关键的基因集合。CircRNA分析平台搭载了共表达分析个性化，简单的选择基因集合以及样本即可完成分析。
百迈客云平台搭载的个性化功能，无需整理复杂的输入文件、无需掌握晦涩的生信语言、不受时间空间的限制，只要有互联网的地方，全年365天，全天24小时均能开展数据挖掘，任何您灵感迸发的瞬间，都可以登陆平台完成分析！目前转录调控全线全产品均已上云，完善的云服务模式深度助力提升客户体验，更多好用的功能期待您的体验！
京公网安备 11011302003368号