分类: 公司新闻

2021年10月19日,由北京百迈客生物科技有限公司主办的“第八届全国功能基因组学高峰论坛-微生物分会场”线上直播会议完美落幕。

全国功能基因组学高峰论坛始于2014年,每年举办一届,至今已成功举办八届,累计邀请近800名专家学者进行大会主题报告,7000余名与会科研人员、近百家大众及行业合作伙伴、媒体朋友参加此盛会,在业界形成了较高的行业影响力和认可度。

大会得到了各位专家、学者的大力支持,本次论坛微生物分会场共邀请到中国科学院水生生物研究所缪炜研究员、山东大学张玉忠教授、自然资源部第三海洋研究所龚林锋助理研究员、中国科学院海洋研究所赵峰副研究员、中国地质大学(武汉)王红梅教授、中科院遗传发育所刘永鑫高级工程师、中南大学肿瘤研究所周文研究员、广东省微生物研究所谢黎炜研究员、内蒙古农业大学孙志宏研究员、中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员等10位著名专家学者,共同探讨研究进展及发展方向。此外,百迈客微生物产品部副总监王年和珀金埃尔默企业管理(上海)有限公司资深应用专家王萌也带来了主题报告。

大会精彩报告

中国科学院水生生物研究所缪炜研究员介绍了“万种原生生物基因组计划”,2019年12月30日,由中国科学院水生生物研究所联合西藏大学、河南农业大学、中国农业科学院兰州兽医研究所、中国科学院北京基因组研究所和华中科技大学等单位共同发起“万种原生生物基因组计划”(Protist 10,000 Genomes Project, 简称P10K),旨在绘制万种代表性原生生物基因组图谱,建立一个大规模的原生生物遗传资源数据库。

山东大学张玉忠教授讲述了“海洋微生物的多样性、独特的生命特征及其适应与进化机制:基因组分析与整合生物学研究。”张老师团队首先从基因组层面,系统揭示了深海、极地海域微生物的多样性及生物地理分布特征;然后,揭示了深海、极地海域微生物独特的生命特征及极端环境适应与进化的基因组学证据。在此基础上,从微生物生理学、遗传学、生物化学与结构生物学等多个层面,系统阐明深海、极地海域微生物独特的生命特征、环境适应与生态效应的分子机制,为开发利用深海、极地海域微生物及其基因资源奠定理论基础。
图片

自然资源部第三海洋研究所龚林锋助理研究员向大家介绍了“深海(热液)生物资源和空间信息大数据平台”,该平台是基于“标准建设,安全保障,高效共享,全面服务”理念,建立以空间信息系统、海洋环境数据为基础的,一系列专业的样品、(微)生物、微生物菌株、基因、化合物的实物信息和基因信息大数据平台,将为深海生物资源的科学研究、开发利用和服务共享提供巨大支撑。

 

中国科学院海洋研究所赵峰副研究员介绍了“深海真核微生物分子多样性与地理分布”赵老师团队利用高通量DNA测序研究了从潮间带到大陆架,直至深海平原、海山和热液区沉积物中真核微生物的多样性和地理分布模式。溯源分析表明:大陆架和深海平原源-汇关系比其他生境更紧密,生境差异对群落变异的贡献大于空间变量和水深。

中国地质大学(武汉)王红梅教授的报告题目:“洞穴地下生物圈的组成、功能及生态学意义”,王教授向大家介绍了洞穴生态系统,洞穴是开发抗生素等新药物的重要来源。随后介绍了洞穴地下生物圈中的微生物:组成及功能,针对大气甲烷氧化菌进行详细讲述。最后对未来大气甲烷氧化菌的未来发展方向进行了展望。

百迈客生物科技有限公司微生物产品部王年副总监带来报告“升级微生物组研究的几款利器”主要介绍了微生物组研究技术,详细介绍了百迈客对PacBio 全长扩增子产品的研发投入,促使技术普及,包括串联建库体系,以及配套的生信算法和专有数据库辅助注释。同时,也介绍了nanopore测序技术在宏基因组测序上的优势和应用场景。紧接着介绍了微生物组和代谢组联合分析研究思路。最后,介绍了如何利用百迈客云平台为科学研究提效。

中科院遗传发育所刘永鑫高级工程师的报告题目是“扩增子和宏基因组数据分析与可视化流程”。刘老师首先介绍了微生物组研究技术,研究方法,详细介绍了分析流程及相关软件。对当前宏基因组数据分析的主流方法进行整理和总结,为同领域研究者更方便、灵活的开展数据分析,快速选择研究分析工具,高效挖掘数据背后的生物学意义提供参考,进一步推动微生物组研究领域的发展。

中南大学肿瘤研究所周文研究员的报告题目是“多发性骨髓瘤肠道微生物-宿主代谢互作机制及干预”,周老师首先介绍了多发性骨髓瘤(Multiple Myeloma, MM)的特点,随后介绍了课题组利用宏基因组测序技术得到的发现,MM患者肠道微生物生态紊乱,并出现氮源微生物的优势生长,肠道微生物-宿主代谢两者互作从而加速宿主MM的肿瘤进程。通过干预MM患者肠道菌群和氮源摄入可作为MM治疗的新靶标。

广东省微生物研究所谢黎炜研究员讲解了“肠道微生物:代谢性疾病的干预窗口”谢老师首先介绍了肠道菌群是多因素诱发肥胖症的承载体,代谢性疾病,例如:2型糖尿病,肥胖和代谢性肝病等,严重损害身体健康,甚至致残致死。研究发现代谢性疾病的发生和发展伴随肠道微生物多样性、种类和功能的变化,谢老师团队近期开展的短期理床低碳减重研究和益生菌代谢产物缓解机体糖脂代谢的研究为代谢性疾病的肠道干预提供了有力的证据。

内蒙古农业大学孙志宏研究员课题组靳炜博士带来了“基于纳米孔的宏基因组测序揭示了人类肠道微生物基因组的暗物质”的主题报告,靳老师介绍了人类肠道微生物组研究进展,提出因为绝大多数研究采用二代测序,导致了无法解决基因组重复区的问题,并使组装连续受到限制。孙老师课题组整合了来自180个人类肠道样本的3.7Tbp Nanopore平台和21.6Tb Illumina平台高质量宏基因组数据,并从中还原符合高质量MIMAG标准的宏基因组组装基因组(MAGs)。该方法将第三代与第二代超深度测序相结合,大幅提高了宏基因组组装的准确性和连续性。

中国科学院北京生命科学研究院赵方庆研究员的报告主题为“微生物组:金矿还是泡沫?”赵老师提出高通量测序技术为基础的微生物组学已经是目前最为关键和成熟的组学方法,也已成为基因组研究领域最活跃的方向之一。赵老师团队重点开发了多种微生物组学研究的新技术和新方法,包括:RiboFR-seq、metaSort、inGAP-sf、inGAP-CDG和CRIPSR-network等。为高效解读微生物组提供了全新的技术手段。

 

PerkinElmer公司资深应用专家王萌带来了“PerkinElmer样本质控及NGS整体解决方案”报告,向大家详细介绍了基于样品质控金标准的LabChip微流控技术,它可以提供全面、高质量的核酸质控数据。随后介绍了LabChip GX Touch提供的全面核酸样本分析及应用案例展示,以及PerkinElmer的NGS全流程解决方案。最后,介绍了PerkinElmer explorer G3全自动平台,可运用于全自动化超高通量NGS文库构建,新冠万人份核酸检测等。

 

在浓厚的学术氛围下,第八届百迈客全国功能基因组学高峰论坛-微生物分会场落下了帷幕!通过这次峰会,充分展示了功能基因组学研究领域的重大进展,加强了行业信息与资源的共享,促进了该领域的交流与合作,将对我国功能基因组学研究的深入和发展起到推动作用。

相信每一位参会人员都受益匪浅,也祝愿每一位研究学者都能喜报频频!让我们共同期待2022年“第九届全国功能基因组学高峰论坛”,我们将继续秉承大会“解读基因、助力科研”的使命,努力将此论坛打造成行业标杆性学术交流盛会!

最近文章