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提问1:我的qPCR实验结果,复孔重复新性差,具体是什么原因导致的?

回复: 1)误差导致,建议加样过程中,使用精密的移液器,且可增大反应体系。

2)仪器长时间未校准,建议将仪器定期校准。

提问2:扩增曲线未达到平台期,如何改善?

回复: 1)模板量太低,可适当增加模板量。

2)循环数太少,可适当增加循环数。

3)基因表达丰度低,建议增加模板量,或者选择合适的试剂盒,确保 能检测出较低基因的表达水平。

除此之外,在qPCR扩增实验过程中,还会出现Ct值偏大、特异性差、荧光强度弱、不适合特有的机型等问题。为了解决以上问题,百迈客推出的一款Biomarker 2× SYBR Green Fast qPCR Mix试剂盒,具有全平台通用、特异性强、扩增性能优越、灵敏度高等特点。

产品简介

Biomarker 2× SYBR Green Fast qPCR Mix采用SYBR® Green I 嵌合荧光法进行qPCR反应,通过对SYBR® / FAM通道进行荧光信号定量检测,可以获得PCR过程中DNA扩增的真实数据。Taq DNA酶采用抗体法热启动进行扩增,可以有效抑制引物退火导致的非特异性扩增,极大地提高产品的特异性。且试剂盒中含有特殊的ROX Reference Dye,适用于所有qPCR仪器。

产品特点

1.兼容性完美,全平台通用:提供ROX Reference Dye I和II预混液,适用于所有主流定量PCR仪器。

2.灵敏度高:采用独特优化的反应Buffer,可检测低至10 pg的cDNA模板。

 
图1:将质粒进行8个10倍梯度稀释,以5×107~100拷贝/µl的质粒为模板,进行扩增。发现扩增效率高,且可获得良好的线性关系。

3.扩增性能优越:短时间内可反复冻融10次以上,扩增曲线依然呈现特征单峰,扩增效率依然很高。

  

图2:以1 μg不同物种的RNA为模板(蓝色:人肝癌细胞;青色:鸡;红色:斑马鱼;黑色:水稻种子),用BiomarkerScript Ⅱ 1st Strand cDNA Synthesis Kit进行逆转录,得到cDNA产物。再以100 ng不同物种的 cDNA为模板,用反复冻融10次以上的Biomarker 2× SYBR Green Fast qPCR Mix进行qPCR扩增。

4.特异性强,适应不同样本:通过抗体封闭聚合酶活性,有极强的特异性,可完美识别植物(种子、叶子、果实)、动物(细胞、组织)等样本的目标基因扩增。

图3:以1 μg不同物种的RNA为模板(红色:人肝癌细胞;蓝色:鸡;黑色:斑马鱼;紫色:水稻种子;黄色:番茄果),用BiomarkerScript Ⅱ 1st Strand cDNA Synthesis Kit进行逆转录,得到cDNA产物。再以100 ng不同物种的 cDNA为模板,用Biomarker 2×SYBR Green Fast qPCR Mix进行qPCR扩增。

5. 重复性好 :设置20个复孔,S型扩增曲线几乎重合。

图4:以1μg水稻种子的RNA为模板,用BiomarkerScript Ⅱ 1st Strand cDNA Synthesis Kit进行逆转录,得到cDNA产物。再以100 ng的 cDNA为模板,设置20个复孔,用Biomarker 2× SYBR Green Fast qPCR Mix进行qPCR扩增。

转录组项目文章发表,大部分的验证都采用了qPCR方案,统计部分百迈客成功案例:人、鼠、家禽、水产、昆虫、经济作物、林木、花卉果蔬等。

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