分类: 医学研究

还在为ChIP实验步骤多而苦恼??

还在为ChIP实验周期长而忧愁??

还在为实验重复性差而不快??

还在为细胞量不够而忧闷??

新产品上市啦
百迈客新产品 CUT&Tag 上市,

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祝您科研无忧!

CUT&Tag技术原理

CUT&Tag实验原理[1]

CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)是一种可应用于表观遗传学领域的DNA-蛋白质互作研究新技术,主要用于研究转录因子或组蛋白修饰在全基因组上的结合或分布位点。

Cut&tag vs ChIP-seq

百迈客实测数据展示

CUT&Tag文库片段分布图

H4K20me1实测图

经典案例解读

蛋白质与DNA互作是基因转录调控的关键,也是启动基因转录的前提。2019年4月29日Henikoff实验室在Nature Communication上公布了新技术CUT&Tag,与传统的ChIP-seq相比,CUT&Tag技术方法简便易行、背景信号低、重复性好、让细胞量从10,000个降到了60个甚至单个细胞。

CUT&Tag、CUT&RUN、ChIP-Seq 实验结果对比:
CUT&Tag 具有更好的信噪比和更低的背景

重复性相关矩阵:
CUT&Tag的灵敏度最高,实验可重复性较好

peak-Calling的对比:
CUT&Tag比CUT&RUN、ChIP-seq或ATAC-seq有更高的信号

CUT&Tag 单细胞测序流程:
能够对极少量细胞(60 个细胞)甚至单细胞进行分析

参考文献

[1] Kaya-Okur HS, et al. CUT&Tag for efficient epigenomic profiling of small samples and single cells. Nature Communication, 2019.

 

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