分类: 基因组测序

中国科学院遗传与发育生物学研究所/玉米等作物种质创新及分子育种全国重点实验室主任谢旗研究员课题组、中国农业大学于菲菲教授课题组以及中国科学院遗传与发育生物学研究所/崖州湾国家实验室李家洋院士课题组合作在Cell杂志在线发表研究论文,题为“Resistance to Striga Parasitism through Reduction of Strigolactone Exudation”。

该研究首次揭示了缺磷环境促进作物SL外排的生理现象,并解析了其分子机制,填补了通过调控SL外排控制独脚金寄生研究领域的空白。百迈客生物为该研究提供了生物云平台分析服务。

研究背景

寄生植物对作物的危害由来已久,其中尤以列当科-独脚金属(Striga spp.)和列当属(Orobanche spp.)寄生植物危害最为严重。独脚金主要危害高粱、玉米及谷子等单子叶作物,而列当则主要危害番茄、向日葵等双子叶作物。二者每年造成约近7000万公顷土地受到侵染,3亿人粮食安全受到威胁,直接经济损失达100-120亿美元。因此,深入研究寄生植物的作用机制,解析宿主与寄生植物互作过程,对于作物抗寄生研究具有重要意义。

高粱是世界第五大粮食作物,起源于非洲萨赫勒地区,具有高度耐逆、耐贫瘠等表型。同时,干旱、贫瘠(尤其是缺磷)条件会诱导作物根系分泌独脚金内酯(Strigolactones, SLs),刺激土壤中独脚金种子的萌发,导致寄生问题。因此,高粱成为独脚金的主要宿主,也常被用作研究植物寄生问题的模式作物。尽管近些年关于通过调控独脚金内酯合成通路来抗寄生的研究有所报道,但对于缺磷环境下作物与独脚金互作的分子机制仍知之甚少。

研究内容及结果

为探究缺磷条件下高粱诱导独脚金寄生的生理过程,研究团队创建了高粱水培缺磷模拟实验系统,并发现在缺磷处理下高粱根系和水培液中SL含量显著升高。进一步通过缺磷处理和SL处理高粱根系转录组测序联合分析,确定了ABC转运蛋白家族编码基因SbSLT1和SbSLT2为高粱SL外排转运蛋白的候选基因。SbSLT1和SbSLT2受到缺磷和SL处理显著诱导表达,表达模式、原位杂交等实验表明SbSLT1和SbSLT2主要在高粱根系表皮细胞表达,符合其外排SL到土壤中的功能特性。

研究团队利用酵母、爪蟾卵母细胞以及拟南芥异源表达系统,证实了SbSLT1和SbSLT2均具有显著的SL转运活性。进一步探究发现它们的同源蛋白SbSLT1-LIKE和SbSLT2-LIKE均不具备SL转运活性,强调了SbSLT1和SbSLT2在高粱ABCG家族转运蛋白中的SL转运功能特异性。

为深入解析SbSLT1和SbSLT2转运SL的分子机制,研究团队利用AlphaFold结合HOLE对SbSLT1和SbSLT2在细胞膜上形成的SL转运通道进行了预测,结合实验结果最终确定了SbSLT1-F693和SbSLT2-F642为关键氨基酸位点,有趣的是,同源蛋白SbSLT1-LIKE和SbSLT2-LIKE并不存在该保守氨基酸位点,这也解释了二者不具备SL转运活性的现象。通过蛋白序列比对发现,单子叶植物中SbSLT1和SbSLT2的同源蛋白与已知的双子叶SL转运蛋白均具有该保守苯丙氨酸位点,说明在单双子叶植物中可能存在保守的SL转运机制。

进一步构建高粱SbSLT1和SbSLT2基因编辑敲除株系进行功能验证,发现敲除突变体材料的根系分泌物中SL含量较对照株系显著降低,且利用该分泌物处理独脚金种子,萌发率显著下降。田间小区实验发现突变掉SbSLT1和SbSLT2基因的高粱寄生率降低了67-94%以上,同时高粱的产量损失减少了49%-52%。

研究总结

综上所述,SbSLT1和SbSLT2基因在提升作物抗寄生能力,减少寄生对作物造成的损失方面具有显著的应用潜力。该研究为高粱、玉米等经济作物抗独脚金等寄生植物寄生问题提供了新的解决策略,为应对寄生植物对全球经济损失和粮食安全威胁具有重要战略意义。

这项突破性研究,不仅揭示了作物抵御寄生威胁的关键机制,更展现了从分子解析到田间验证的完整科研闭环。值得注意的是,百迈客生物云平台为该研究的数据分析提供了重要支撑,再次印证了现代生命科学的重大突破,早已离不开生物信息学的强大支撑。

作为连接实验数据与科研结论的核心桥梁,生信技能已成为前沿科研人员不可或缺的核心竞争力 —— 从基因组序列的精准组装、转录组表达谱的差异分析,到表观遗传修饰的特征挖掘、代谢组与表型组的关联解析,再到分子调控网络的构建与验证,每一个关键科研环节都离不开生信技术的深度参与。它不仅能帮助科研人员从海量、复杂的生物数据中挖掘出隐藏的生物学规律,更能打破传统实验研究的局限,实现 “数据驱动科研创新” 的全新范式。

可以说,掌握扎实的生信技能,就意味着手握了打开生命奥秘之门的钥匙,能够在前沿科研领域抢占先机,加速从基础研究到产业应用的成果转化。

最近文章