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 分类: 时空组学

亚细胞级别分辨率的细胞分割算法

期刊: Nature Methods

IF:48

时间:2023年7月

全文:http://www.biomarker.com.cn/wp-content/uploads/2023/08/unnamed-file-4.pdf

作者开发了命名为亚细胞空转细胞分割技术的算法:SCS。该算法相比其他分割算法更为准确地识别每个细胞的位置,并能标注其细胞类型。还能进一步提供有关细胞内RNA分子的亚细胞定位的信息。从而使研究人员能够深入探究细胞在组织内的活动。

单细胞技术解析灵长类脊髓损伤修复机制

期刊:Nature Communication

IF:16.6

时间:2023年8月

全文:http://www.biomarker.com.cn/wp-content/uploads/2023/08/unnamed-file-5.pdf

作者通过对构建的胸段全横断脊髓损伤恒河猴模型进行了单细胞转录组测序,深入解析了完全性脊髓损伤近端和远端不同区域的细胞动态变化。并进一步研究了胶原材料支架移植对完全性脊髓损伤不同区域的治疗效应和机制。

同时检测转录水平与Hi-C的单细胞多组学技术

期刊:Nature Structural & Molecular Biology

IF:16.8

时间:2023年8月

全文:http://www.biomarker.com.cn/wp-content/uploads/2023/08/hicmrna.pdf

作者建立了能实现了在单个细胞中同时检测染色质三维结构(Hi-C)和转录表达的单细胞多组学技术方法——scCARE-seq。并利用小鼠胚胎干细胞中验证了该方法的效果。结果表明,此方法优化了单细胞Hi-C聚类结果,矫正了细胞周期的干扰,进一步促进Hi-C与转录之间动态调控关系的研究。

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