近年来基因家族的生物信息学分析已经成为大家研究的热点,目前已经表明许多重要的基因,如一些转录因子,都是以基因家族的形式存在。本课程系统的对基因家族进行了生物信息分析,让大家更加深入学习了解基因家族分析研究,从而进一步丰富我们研究的内容,提升文章档次,实现科研成果的快速产出。
基因家族发文回顾
我们统计在2021年发表了1319篇相关的基因家族文章,而2022年到目前已经发表了1241篇(使用genome wide of gene family关键词检索)。可以看到基因家族文章这种套路文章发文之大。且如果进化做的好,可以分析一个基因家族在多个物种中演化规律,即可发更高水平的文章。
2021年部分基因家族发表文章
2022年部分基因家族发表文章
课程特点
随时在线实战练习
每位生信学员均配有自己的专属练习账号,练习服务器24小时不停机,保证学员随学随用,课下即可学以致用。
可视化操作
为满足初学者的需要,我们在命令行教学的同时,还准备了可视化练习的方式,让初学者更好入门,动动鼠标即可实现在线分析做图。
课件丰富
所有课程都有详细的学习文档,每一步的操作步骤都会在文档中详细列出。而且课后还可反复观看上课视频,有问题随时售后群中交流沟通,真正实现“线上学习理解,课后练习指导,课下文档复习”。
课程详情
1、培训形式:线上直播+录播
2、培训时间:2022年12月15-18日
3、培训费用:1999元/人(含资料,一年视频观看及本次直播观看权限)
课程详情
日 期 | 课 程 | |
2022/12/15周四 (9:00-12:00;14:00-18:00) |
Linux基础 | 1、Linux系统介绍 2、Linux常用基本命令 3、Linux文件系统 |
2022/12/16周五 (8:30-12:00;14:00-18:00) |
基因家族文献讲解与基础数据下载 | 1、文献讲解 2、TAIR数据库下载家族成员 3、PlantTFDB数据库下载家族成员 4、Pfam数据库下载家族成员 5、NR数据库下载家族成员 6、Uniprot数据库下载家族成员 7、NCBI数据库下载基因组 8、Ensemble数据库下载基因组 9、JGI(Phytozome)下载基因组 |
家族成员鉴定 | 1、BLAST鉴定 2、HMMER鉴定 3、关键结构域鉴定 4、基因在染色体上定位展示 5、各成员基本信息统计 |
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2022/12/17周六 (8:30-12:00;14:00-18:00) |
进化树构建 | 1、进化树构建的基本原理 2、MEGA使用 3、IQ-TREE 4、Evolview进化树美化 |
基因结构特征分析 | 1、MEME Motif鉴定 2、GSDS基因结构展示 3、进化与特征组合绘图 4、启动子鉴定 |
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2022/12/18周日 (14:00-18:00) |
共线性分析及进化分析 | 1、MCScanX软件 2、基因组间共线性展示(JCVI) 3、ka/ks calculator 计算Ka/ks |
转录组表达量计算 | 1、SRA数据下载 2、hisat2-stringtie2获取表达量 3、热图绘制(MEV) |
钜惠活动
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买就送:购买“基因家族”课程,赠送1000元以下,任意生信课程!!
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2021百迈客云课堂会员卡制
普通会员:任选4个生信课程,
6000元/年
银牌会员:任选6个生信课程,
8000元/年
金牌会员:任选10个生信课程,
11000元/年
铂金会员:任选13个生信课程,
13000元/年
会员权益:
1、包含云收费视频包:百迈客云课堂现有价值近6千的收费课程免费看(除以上生信课程外)
2、不限次直播课程:所选课程对应1年的直播观看权限,观看直播不限次
3、线下活动:会员线下活动每年至少一次,活动不仅有专家、有美食、有美酒同时还有美景与技术牛
4、金牌、铂金会员另赠送百迈客第八届全国功能基因组学峰会门票(峰会为>500人会议,现已举办7届,每届均有院士大牛参加)
5、收费工具免费用:生信课程中同样分析可选择代码或在线工具实现,其中收费在线工具可有3个月免费使用权
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