为促进学术交流合作,推动百迈客生物多组学之——微生物组学在医学、农业等领域应用与发展,将每周为大家分享微生物组学前沿研究热点,涵盖最新文献和技术,关注微生物组与健康、疾病、环境等关系,为科研人员提供全面深入的微生物组学研究资讯。
【本期看点】
一、Signal Transduction and Targeted Therapy(IF 39.3):肿瘤内微生物群:癌症发展和治疗的新领域
二、Gut ( IF 24.5 ) :质子泵抑制剂通过促进口腔微生物群易位来改变肠道微生物群:一项前瞻性介入研究
三、Microbiome(IF 15.5):揭示珍珠粟根系分泌物、微生物群和根鞘形成之间的相互作用
四、Water Research(IF 12.8):聚乙烯微塑料引起的微生物变化影响沿海湿地沉积物垃圾分解过程中的温室气体排放
五、Science of the Total Environment(IF 9.8):污染环境中肠道健康与肠道微生物群之间的关联
Signal Transduction and Targeted Therapy(IF 39.3):肿瘤内微生物群:癌症发展和治疗的新领域
研究重点
人类微生物,包括细菌、真菌和病毒,在多种生理和病理过程中发挥着关键作用。一些研究发现,曾经被认为无菌的肿瘤组织实际上寄生着多种微生物,这些微生物已被证实与肿瘤发生密切相关。随后提出了瘤内微生物群的概念。微生物群作为肿瘤微环境的重要组成部分,可以通过黏膜破坏、邻近组织迁移、血源性侵袭等方式定植肿瘤组织,影响肿瘤的生物学行为。机制研究表明,肿瘤内微生物群可能通过诱导基因组不稳定和突变、影响表观遗传修饰、促进炎症反应、避免免疫破坏、调节代谢、激活侵袭和转移来促进肿瘤的发生和进展。人类微生物,包括细菌、真菌和病毒,在多种生理和病理过程中发挥着关键作用。一些研究发现,曾经被认为无菌的肿瘤组织实际上寄生着多种微生物,这些微生物已被证实与肿瘤发生密切相关。随后提出了瘤内微生物群的概念。微生物群作为肿瘤微环境的重要组成部分,可以通过黏膜破坏、邻近组织迁移、血源性侵袭等方式定植肿瘤组织,影响肿瘤的生物学行为。机制研究表明,肿瘤内微生物群可能通过诱导基因组不稳定和突变、影响表观遗传修饰、促进炎症反应、避免免疫破坏、调节代谢、激活侵袭和转移来促进肿瘤的发生和进展。
英文题目:Intratumoural microbiota: a new frontier in cancer development and therapy
作者:Yaqi Cao, Hui Xia, Xueyun Tan, Chunwei Shi, Yanling Ma, Daquan Meng, Mengmeng Zhou, Zhilei Lv, Sufei Wang, Yang Jin
DOI:10.1038/s41392-023-01693-0
Gut ( IF 24.5 ) :质子泵抑制剂通过促进口腔微生物群易位来改变肠道微生物群:一项前瞻性介入研究
研究重点
1、质子泵抑制剂(PPI)降低了肠道微生物多样性并改变了分类群;
2、肠道微生物群对人类健康至关重要,PPI给药通过增加口腔源链球菌的肠道丰度来改变肠道微生物群 ,PPI促进血管内S. anginosus 向小鼠肠道的易位,漱口水降低了PPI给药后肠道链球菌的丰
度;
3、动物模型和体外研究证实PPI使用者肠道中的细菌来源于口腔。
英文题目:Proton pump inhibitors alter gut microbiota by promoting oral microbiota translocation: a prospective interventional study
作者:Xue Xiao, Xian Zhang, Jin Wang, Yuqiang Liu, Hailin Yan, Xiaocun Xing,Jinlin Yang
DOI:10.1136/gutjnl-2023-330883
Microbiome(IF 15.5):揭示珍珠粟根系分泌物、微生物群和根鞘形成之间的相互作用
研究重点
1、使用具有对比土壤聚集能力的四个不同品系研究了根系分泌物对珍珠粟中微生物群组成、相互作用和组装过程以及根鞘结构的影响;
2、利用 16S rRNA 基因和 ITS 元条形码进行微生物群分析,结合对不同植物区室和根系分泌物中代谢物组成的 FTICR-MS 代谢组学分析,揭示了微生物多样性和相互作用网络的巨大差异;
3、根组织 (RT) 和根附着土壤 (RAS) 的代谢特征反映了它们的土壤聚集水平,强调了植物固有性状对微生物群组成以及 RT 和渗出液中独特代谢特征的影响;
4、抗菌化合物(包括 DIMBOA 和 H-DIMBOA)出现在根系分泌物和低聚集系的 RT 中。这项研究强调了根系分泌物在塑造整个珍珠粟品系中与根部相关的微生物群组成方面的关键影响,与其土壤聚集能力密切相关,加深了对土壤-植物-微生物相互作用和塑造根际微生物群落的生态过程的认识。
英文题目:Unraveling the interplay between root exudates, microbiota, and rhizosheath formation in pearl millet
作者:Abdelrahman Alahmad, Mourad Harir, Sylvain Fochesato, Joris Tulumello, Alesia Walker, Mohamed Barakat, Papa Mamadou Sitor Ndour, Philippe Schmitt-Kopplin, Laurent Cournac,
Laurent Laplaze, Thierry Heulin, Wafa Achouak
DOI:10.1186/s40168-023-01727-3
Water Research(IF 12.8):聚乙烯微塑料引起的微生物变化影响沿海湿地沉积物垃圾分解过程中的温室气体排放
研究重点
1、探讨了聚乙烯微塑料(PE-MP)影响沿海沉积物垃圾分解过程中温室气体(即CO2、CH4和N2O)排放的微生物机制;
2、在凋落物分解过程中,PE-MP暴露使累积CH4和CO2排放量分别显着降低了41.07%和25.79%。然而, PE-MP暴露下累积N2O排放量没有显着变化;
3、随着时间的推移,沉积物中的细菌、古菌和真菌群落对 PE-MP 暴露表现出不同的反应,这反映在微生物群结构的改变和功能组的改变上。由于 PE-MP 暴露和沉积物性质变化而改变的微生物功能群可能有助于抑制凋落物分解过程中的 CH4和CO2排放。
英文题目:Polyethylene microplastic-induced microbial shifts affected greenhouse gas emissions during litter decomposition in coastal wetland sediments
作者:Simin Wang, Qixing Zhou, Xiangang Hu, Zongxin Tao
DOI:10.1016/j.watres.2024.121167
Science of the Total Environment(IF 9.8):污染环境中肠道健康与肠道微生物群之间的关联
研究重点
1、对暴露于放射性核素污染的野生动物种群的肠道微生物群和驱动肠道健康的宿主健康方面进行了全面调查;
2、证明暴露于放射性核素与肠道微生物群组成的变化有关,肠道菌群的变化与野生田鼠肠道健康的改变有关;
3、息在受污染环境可能对动物肠道健康产生广泛影响,提示在生态毒理学研究中应同时考虑肠道健康和肠道微生物组。
英文题目:Association between gut health and gut microbiota in a polluted environment
作者:Toni Jernfors, Anton Lavrinienko, Igor Vareniuk, Rikard Landberg, Rikard Fristedt, Olena Tkachenko, Sara Taskinen, Eugene Tukalenko, Tapio Mappes, Phillip C. Watts
DOI:10.1016/j.scitotenv.2023.169804
百迈客云交互式更新7项分析内容,宏基因组交互式同步更新中
百迈客云微生物多样性APP新增7项图片交互式功能,内容包括Beta多样性分析中的PLS-DA分析,microPITA分析、功能预测分析(PICRUSt2功能预测、BugBase表型预测、Tax4Fun功能预测、FAPROTAX功能预测),百迈客云宏基因组APP也将同步更新中……