三代微生物多样性是基于 PacBio 测序平台，利用单分子实时测序（SMRT Cell）的方法，基于HIFI模式对对单一片段进行多轮测序，在确保测序片段的长度的同时，也确保了单一片段测序数据的准确性。基于其超长读长的特点，可直接获得全部变异区序列信息，获得到“种”的分类鉴定，从而更加真实地还原样本中微生物的群落结构。
经过不断的经验积累，百迈客目前已拥有3500+项目交付，80000+样本测序经验，研究成果涵盖土壤，淤泥，根际，水体，深海冷泉，沉积物，反应器，发酵体系，肠道，粪便等多种组织类型，平均单篇影响因子8分以上，助力客户进入精细微生物组研究时代。下面我们一起来看下文章案例思路~
客户案例一：全长微生物多样性（细菌全长 16S）+ 细菌框架图助力客户解析油茶根内生菌Streptomyces sp. CoT10的磷周转机制和促进植物根际调节。
文章题目：Siderophores, a potential phosphate solubilizer from the endophyte Streptomyces sp. CoT10, improved phosphorus mobilization for host plant growth and rhizosphere modulation
期刊名称：Journal of Cleaner Production
影响因子：11.072
发表时间：2022年7月
合作单位：湖南大学
研究内容：土壤中的可用磷（AP）缺乏是农业和林业生产中的一个重要限制因素。因此，具有高磷动员能力的微生物是非常值得关注的，特别是在酸性土壤中，大部分P被Fe固定。油茶是一种典型的酸性土壤种植油料作物，在我国林业经济体系中具有较高的地位。在这项研究中，作者从油茶内生菌中筛选并鉴定了链霉菌株CoT10。CoT10可以有效地调动不同的P资源，特别是对FePO4表现出高溶解度，并在生产不同的副产物方面表现突出。接种CoT10改善了土壤微生物多样性，放线菌、变形菌、厚壁菌等优势群的比例明显增多。此外，冗余分析（RDA）、网络分析和功能预测表明，接种CoT10改善了油茶根际土壤中的微生物相互作用，平衡了土壤微生物P和Fe相关的功能作用。CoT10及其铁载体为调节富铁土壤中磷的迁移提供了一种有价值的方法，以促进植物相关产业的可持续和生态友好型发展。
客户案例二：全长微生物多样性（细菌全长 16S）+ 代谢组联合分析助力客户定向分离能够增强海稻耐盐性的根际植物生长促进菌。
文章题目：Microbiome-metabolome analysis directed isolation of rhizobacteria capable of enhancing salt tolerance of Sea Rice 86
期刊名称：Science of The Total Environment
影响因子：10.753
发表时间：2022年6月
合作单位：广东海洋大学
研究内容：土壤盐碱化被认为是导致耕地面积和全球植物生产力减少的主要因素之一。应用耐盐植物和提高植物耐盐性被认为是盐渍土恢复和利用的主要途径。海稻86（SR86）被称为能够在盐碱土壤中生长的水稻品种，本研究以SR86幼苗不同盐度下根际细菌多样性和土壤代谢组为研究对象，了解其对植物耐盐性的贡献。研究发现盐胁迫可以显著改变根际细菌多样性和根际代谢物。通过共生分析确定了关键分类群，关键分类群与根际代谢物之间的相关性分析表明，脂类及其衍生物可能在植物耐盐性中发挥重要作用。此外，进一步分离出了四种能够促进SR86耐盐的植物生长促进菌（PGPR），并对其进行了表征。研究结果可为植物-微生物相互作用介导的植物耐盐机制提供新的思路，促进PGPR在盐渍土恢复利用中的分离和应用。
客户案例三：全长微生物多样性（细菌全长 16S + 古菌全长 16S）+ 宏基因组助力客户探索嗜化原核生物如何驱动中国南海绝迹冷泉的碳、硫、氮循环。
文章题目：Riddles of Lost City: Chemotrophic Prokaryotes Drives Carbon, Sulfur, and Nitrogen Cycling at an Extinct Cold Seep, South China Sea
期刊名称：Microbiology spectrum
影响因子： 9.043
发表时间：2022年12月
客户单位：中国科学院南海海洋研究所
研究内容：深海冷泉是由流体携带的碳氢化合物维持生产力的生态系统之一。一旦流体停止，繁荣的自养群落就会消亡，被称为绝迹冷泉。但异养生物群甚至可以存活数千年。原核生物在活跃冷泉中的关键作用已明确，但迄今为止人们对它们在绝迹冷泉中的功能知之甚少。此研究阐明了南海海马冷泉已绝迹冷泉地点沉积物原核生物的多样性、分类特异性、种间相关性和代谢特征。与活跃冷泉相比，已绝迹冷泉的古菌α多样性显著增加，而细菌的α多样性保持不变。然而，基于加权层面，古菌组成在活跃或非活跃位点的绝迹冷泉处没有显著差异，而细菌组成表现出显著差异。古菌和细菌的分布在已绝迹的冷泉中表现出明显的特异性，表明了这里独特的生命特征。原核生物可能在无机碳、硫和氮的循环中以化学自养方式生活，或在碳氢化合物的循环中以化学有机体营养的方式生活。值得注意的是，许多已绝迹的冷泉特定物种和网络的关键谱系被归类为变形杆菌。关于该分支的功能多样性和代谢灵活性，变形杆菌被认为整合了地球化学循环，并在绝迹冷泉微生物组的能量和资源补充中发挥关键作用。总的来说，研究结果揭示了已绝迹冷泉中的微生物生态学和功能多样性，为流体停止后的生物地球化学循环提供了新的理解。
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