分类: 文献秀

活动信息

时间:09月17日 16:00

形式:免费线上直播

文献研究背景

植物的根往往被土壤细菌所侵染,这些细菌被认为是抗生素抗性基因(ARGs)的主要接纳体。ARGs可以在这些微生物和病原体之间转移,但这些ARGs和病原体在多大程度上从土壤传播到植物的机制还不清楚。作者使用扩增子和宏基因组测序研究了红树林幼树土壤-根系连续体的高分辨率抗性剖面。数据显示,91.4%的ARGs在4个与根系相关的空间(内圈、epis圈、根圈和未种植土壤)共享。与微生物区隔选择动力学不同,导入以一种连续的方式散布在土壤-根系连续体上。这种传播与潜在的根系相关的细菌和真菌微生物群无关,但可能是由多种可移动遗传元素促进。创伤弧菌、致病性大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌作为多药耐药病原菌,在4个隔室中均占主导地位,表明抗生素病原菌可能沿土壤-根系连续体传播。通过解读根系相关抗性和病原体的形态和动态,作者的研究确定了土壤-根系连续体是一个相互连接的汇,通过它,某些ARGs和病原体可以从土壤流向植物。
本期文献秀,我们就邀请了本文的第一作者胡瑞文博士来给大家分享该篇文献的科研经历。

本期分享文献

文献题目:Prevalence of antibiotic resistance genes and bacterial pathogens along the soil-mangrove root continuum

发表期刊:《Journal of Hazardous Materials 》

发表时间:2021年4月

影响因子:10.588

第一作者:胡瑞文 中山大学

点击查看文献解读:

https://mp.weixin.qq.com/s/mSf-OFUapJw6Upy1Yf9BYg

本期分享嘉宾

胡瑞文 博士

主要从事环境微生物组相关研究,关注的研究方向:1,环境污染物的微生物降解;2,环境微生物的相互作用机制; 3,河口与海洋生态系统中微生物介导的元素循环。

张雨 研发工程师

毕业于武汉大学,具有5年微生物组学研究经验,目前负责宏基因组生信分析相关研发工作。

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