物种数据库帮您更快发表高分文章！

百迈客物种数据库是一个将多组学数据高度整合、集成在一起，实现数据的浏览、查询、再度挖掘的综合性平台。

为了更好的服务于科研，物种数据库推出了V2.0版：不但可共享研究成果，而且通过后台管理系统可以完成logo、文字描述、配色、单位等信息的修改，更重要的是可以实现新增数据的一键式部署。

更更重要的是，数据库也可以发表高分文章哦！

百迈客物种数据库核心功能介绍

标准版数据库：http://bio-db-demo.biocloud.net/home

• Browse

标准版Browse模块中共部署了7个子模块进行核心数据的浏览，如Browse中的Annotation模块，链接：http://tomato.biocloud.net/page/browse/Annotation

功能说明：

• 选择物种
• 选择所关心的注释数据库类型（默认是All）
• 输入所关心的基因ID或者功能注释关键字

• Search

标准版Search模块中共部署了5个子模块完成数据的查询、检索，如Search模块中的Multicriteria Search，

链接：http://bio-db-demo.biocloud.net/page/search/multicriteriaSearch

功能说明：

• 选择待检索的变异类型，SNP  或者 Indel
• 选择在哪个版本的参考基因组中检索结果
• 输入检索的染色体区域
• 输入要检索的基因ID
• 输入要检索的变异ID

注 3、4、5三个选项只能选择一个哦！

• 选择要在哪个品种中进行检索
• 具体要检索的Type类型
• 具体要检索的基因型Genotype

点击Search后，即可完成特定样品在特定条件下的变异详情信息了，结果中还包括了变异位点上下游20bp、及500bp的序列信息，便于用户进行引物设计。

• Tools

标准版Tools模块中共部署了8款工具用于对库中多组学数据的进一步深度挖掘：

• 基于局部比对算法的搜索工具：Blast、Blat
• 基因组浏览器：Gbrowse、Jbrowse，用来展示各种基因信息，比如基因的外显子内含子，比如转座子和重复序列或者SNP/Indel
• 计算个体表型数据的工具：TRAIT
• 基因共表达网络图：Gene network
• 引物设计软件：Primer Design
• 基因表达量热图：Expression Visualization

如Tools模块中的Expression Visualization，

链接：http://bio-db-demo.biocloud.net/page/tools/expressionVisualization

功能说明：

• 输入关心的基因ID，基因ID之前以逗号分隔
• 选择特定个体、特定组织在特定处理条件下的样品

点击“Display Expression Heatmap”即可构建出表达量热图

• 后台管理

通过管理员账号登录后台后，不但可以编辑背景色、轮播图、各个模块的文字描述，而且底层数据也可以通过后台进行上传、管理。

再也不需要占用一个被灰尘落满的硬盘存储科研数据了；

再也不需要配备专业的美工去完成页面背景色的修改了；

再也不需要哀求专业的IT开发工程师、运维工程师去完成底层数据的更新了（替换、追加随您便）；

背景色的编辑：

Home页内容编辑：

我们通过上面4部分内容，对百迈客物种数据库的功能做了一个简单的介绍。

如果想了解更多的功能，

如果想了解更多的后台管理功能

如果您想为您的科研数据部署一个数据库

请通过网站查看–http://bio-db-demo.biocloud.net/home

 

成功案例：

虾数据库：http://shrimp.biocloud.net

番茄数据库：http://tomato.biocloud.net