生信零基础,如何进行代谢组学生信分析?

还记得3月6日惊蛰,百迈客发生的大事件吗?没错,为了帮助广大科研工作者获得更准确的检测数据,百迈客强势引进Waters UPLC I class PLUS 及Xevo G2-XS QTOF,同时全面上线代谢组云分析工具,极速缩短分析周期,提升个性化数据挖掘空间。

那么今天来唠一唠全面上线的代谢组云分析平台,该平台优势在于生信零基础的科研小伙伴,也能快速进行代谢组学数据分析哦,闲话不说,来来来,听大神絮叨一会,小白也能秒变大神呢,come,on!

代谢组云分析平台是什么?

百迈客云提供专业的生信分析平台(http://www.biocloud.net/),最新上线的代谢组云APP兼具标准分析、联合分析和个性化分析功能,同时海量在线资源以供学习和使用。

代谢组APP如何使用?

首先,您需要登录到百迈客云平台网址(http://www.biocloud.net/),点击全部导航->分析->农学

在农学分析各平台右侧选择代谢组分析平台,如下图:

点击,选择打开软件

打开软件之后,代谢组信息分析开始了,首先输入项目名称,用于区分不同的分析项目。

正式分析开始了哦,总共分3步:

第一步

在代谢定量文件中导入质谱检测得到的代谢物的定量文件

 

文件的格式如下:

注:第一列为代谢物ID,第二列为代谢物定性名称,第三列至最后为各个样本的定量信息。

第二步

综合选项选择,包括注释物种分类、分析报告名称、物种名、归一化方式等

 

KEGG注释分类:根据我们所分析的物种选择相对应的分类。这样方便我们得到更准确的注释结果。

归一化方式:对我们的定量结果进行标准化的方式。如果我们自己已经做过归一化,那么选择否就可以。

第三步
设置差异分析的条件:包括差异倍数、T检验p值、VIP值、以及差异分组

在进行分组设置时,我们可以自由添加分组,设置自己的组名,并在组名之后添加用于差异分析的样品。

最后点击提交,半个小时即可轻松完成12项标准分析内容啦!剩下的就是坐等分析结果喽~

当然除了以上标准分析,云平台可以进行深入的个性化分析以及多组学联合分析(代谢组和转录组联合、代谢组和微生物联合),有木有很期待,扫描以下二维码报名,下期大神教小白如何进行个性化和联合分析哦。

 

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