一个“神奇的”群体

一提起基因定位就是双亲群体、自然群体，是不是听烦了？这回来个新鲜点的群体：MAGIC群体，话说，那是什么神奇的群体呢？

MAGIC群体

多亲本重组自交系（Multiparent Advanced Generation Inter-Cross，即MAGIC群体），是由多个亲本通过两两杂交得到一个包含所有亲本信息群体，而后经过数代近交或自交产生一个稳定的群体，其后代每个个体遗传信息是由所有亲本组合而成，而对于每一个位点则是一个纯合或接近纯合，即来自于同一个亲本。

MAGIC群体构建方法

图1 MAGIC群体构建过程

        还记得把大象装进冰箱分几步吗？三步呗-开门，塞进去，关上。同样构建MAGIC群体也分三步：

第一步，开门——选择亲本：结合研究目的，保证遗传基础和表型的多样性。

第二步，塞进去——杂交：其目的在于保证子代可包含所有亲本的遗传信息，得到一个广的遗传多样性，同时增加染色体片段间的重组，提高后续的QTL检测分辨率。通常两小步：1）以8亲本为例，简单描述为，8个亲本成对杂交，然后子代再两两杂交，形成2个4亲本家系群体，此时杂交过程为漏斗式；2）将2个4亲本群体中不同家系杂交，最后形成一个群体，其中的每个家系均含有所有亲本的遗传信息。（仔细想还是很复杂的~~）

第三步，关上——近交或自交：以单粒传的形式不断自交得到RIL系或者构建双单倍体（DH系），得到相对稳定的个体，得到最终MAGIC群体。

为什么构建MAGIC群体

通过选择多个亲本，增加群体遗传多样性，利用杂交和自交（或近交）两种手段把多个亲本融合到一个群体，增加重组次数。MAGIC群体不仅能够增加重组发生次数，挖掘复杂性状背后的遗传基础，而且由于选择亲本遗传基础的丰富性，在育种应用上具有很大潜质。

和传统群体比较，存在的优势如下：

（1）相对于双亲群体，MAGIC群体的亲本数目量大，增加了群体变异丰富度，包括等位基因多样性和表现型多样性，提供作图z确度和√确度，且提高QTL检测效率，大量累积的重组事件会提高QTL定位分辨率；因为MAGIC群体的亲本筛选更为精细，即标准更为严格，多个亲本增加了遗传基础的多样性，所以其QTL结果可直接应用于育种；

（2）相对于自然群体，MAGIC群体是多亲本混合均匀构建而来，相较于自然群体，因其可以知道系谱关系，存在群体构建的详细信息，从实验设计方面，避免群体分层，进而控制定位结果假阳性问题。

参考文献：

Pascual L, Desplat N, Huang B E, et al. Potential of a tomato MAGIC population to decipher the genetic control of quantitative traits and detect causal variants in the resequencing era[J]. Plant Biotechnology Journal, 2015, 13(4):565-577.

 

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