【干货分享】细胞信号通路研究全套资料下载

纵观现如今的科研发展趋势,无论哪方面的研究都脱离不了分子机制,其实归根结底就是搞明白信号通路中上下游的基因是怎么调控的,受到了哪些因素的影响,其网络的复杂程度和研究的难度,想想都让人却步,好在我们站在了巨人的肩膀之上,科学家及相关专家已经帮我们整理成了交互性信号转导通路示意图,以便于我们获取最直接的科研思路。

具体的细胞信号通路,可通过关注“百迈客医学”公众号,回复“细胞信号通路”下载。

信号通路研究策略

之前,在博客上看到过一篇信号通路研究策略的博文,在此分享一下:

以信号通路为主题的研究,一般来说,按照研究深度可以分为包括:效应、通路、分子和序列四个层面,研究步骤如下:

1、从效应出发(如细胞凋亡),通过涵盖多通路的手段进行中等通量的筛选(蛋白或者RNA水平,比如蛋白芯片或者PCR芯片等),以确定参与该效应的通路,以及该通路的激活或者抑制状态;

2、以某一通路为单位,通过低通量实验WB、qPCR等手段,明确通路中的关键分子的变化,比如表达差异、定位异常、活性变化等;

3、以某一分子为单位,通过分子共表达相关性、分子互作手段(如IP、GST-Pull down等)、分子定位、活性、构象等检测手段,进一步明确分子作用的方式,以及结合的序列、结构域等。

第一步骤的研究是以效应为单位的分解,分解产出是通路。这里说的效应是比较大的概念,比如既可以是疾病水平,又可以是细胞水平,比如在确定肿瘤转移相关通路时,既可以通过转移、非转移样本进行筛选,又可以通过不同转移能力的细胞系进行筛选,这时基本单元是通路,而通路的状态又可以分为激活、抑制等。那么如何判断一条通路是被激活还是被抑制?答案是看通路的下游效应分子应答表现,比如被上调、被激活还是重定位等等。

第二步骤的研究是以通路为单位的分解,分解产出是分子。通路与分子类似,既可以看通路被激活、抑制的上游即原因,也可以看通路被激活、抑制的下游即结果, 不过很少说通路被上下调。即:我们看到的是一个黑箱(Black Box),我们知道效应改变下某一通路被激活或抑制,而通路涉及太多分子,信号在通路中逐级放大。我们可能检测到了一些分子在通路中异常,却不知道哪些分子是信号接收放大的起点。因此第二步骤的目的是从诸多分子中找到通路中信号接收的起点。从通路到信号接收分子的实验方法一般有:共表达关系、直接互作、共定位等。

第三步骤的研究是以分子为单位的分解,分解产出是序列。这一步骤承接第二步,在找到关键分子后,对分子进行分解到结构域和位点,一般做到这个程度的话就已经非常偏基础了,这也是高分文章通路研究中的不成文规定。

信号通路画图软件

不是所有的研究都有现成的细胞信号通路图,假如没有,你需要用到下面的2款软件进行自己绘图:

1、ScienceSlides2005
ScienceSlides 2005是一个PowerPoint插件,包含1600多个生物医学相关对象,在做PPT文件时可以直接通过工具条插入使用这些对象,从而免去了到处找相关文件的麻烦,也省了要切换软件拷贝粘贴的麻烦,提高做PPT的效率。ScienceSlides 2005的对象和模板涉及Biochemistry、Pharmacology、Methods、Biology、CommonShapes、Molecular、Pathology、Signaling等领域。

 

2、Portable Pathway Builder Tool V2.0
pathway builder tool简单易学,美观,自带几乎所有分子生物学会用到的元素,如不同的细胞,细胞器,分子,老鼠模型… 另外,这个软件自带很多经典通路,在上面可以直接修改,非常方便,修改完成后可以保存。

 

软件下载方式

ScienceSlides2005:关注“百迈客医学”公众号,回复“ScienceSlides”下载
Portable Pathway Builder Tool V2.0:关注“百迈客医学”公众号,回复“Pathway Builder”下载
信号通路研究策略引自小张聊科研的博客:http://blog.sina.com.cn/u/5908556998
细胞信号通路收集自Cell Signaling Technology:https://www.cst-c.com.cn/contents/science/cst-pathways/science-pathways

 

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