Q4. miRNA命名规则是怎样的？

答：
参照miRBase的命名规则：{物种名缩写}-miR-{编号};miR-前缀后面所跟着的数字，代表命名的顺序，比如，miR-124比miR-456发现得早。“miR-”代表成熟的miRNA、“mir-”代表pre-miRNA和pri-miRNA、“MIR”代表编码miRNA的基因。
miRNA几乎全是独一的编码顺序，但对于拥有一两个碱基不同的则会被标上字母以示，例如，miR-124a与miR-124b。 若成熟的miRNA相同，但pre-miRNA和pri-miRNA和编码他们的基因来自于不同的基因组，则使用数字来表示，例如，mir-194-1和mir-194-2表示两个pre-， pri-miRNA剪切后的成熟miRNA是完全相同的，但却是两个不同的来源。
前缀的三个字母代表了不同的种族来源，例如，hsa-miR-194代表miRNA来源于人类，oar-miR-124来源于绵羊。
对于形成pre-，pri-miRNA茎环的两端miRNA， 通常一端在数量上远远超过另一端。数量优势的一端往往称为guide strand，而另一端被称为passenger strand，通常被大量降解，用*号来表示，例如miR-124和miR-124*。
最新版中miRBase已经不再使用*来标记microRNA与其发夹前体互补配对位置的互补序列，而是使用“-3p”与“-5p”作为区分这两条序列的后缀替代旧的的命名法。(参考http://www.mirbase.org/help/nomenclature.shtml)
举例： aly-miR158b-3p， aly 代表这是Arabidopsis lyrata 物种的miRNA, -miR158b表示这是成熟的miRNA , 其中b表示还有一个miRNA序列与它相似，仅有一两个碱基不同。 -3p 表示它从前体的3’端剪切得到。
对新预测的miRNA 我们统一用 novel_miR_{数字编号} 来命名， 如 novel_miR_4974。