Q2. 如何进行动植物的miRNA的靶基因预测？

答：植物miRNA可与mRNA的编码区完全互补配对，并通过诱导mRNA降解而发挥抑制表达的作用。动物miRNA则可与mRNA的3’UTR区部分互补配对结合，进而抑制翻译的进行，一般的，miRNA与mRNA的配对区域位于miRNA的5’端的 2-8个碱基，称为种子区，只要种子区能与mRNA互补配对即可发挥作用，这也是一个miNRA能够调控数百条mRNA的原因。
我们根据已知miRNA和新预测的miRNA与对应物种的基因序列信息，植物用 TargetFinder软件进行靶基因预测；动物用miRanda和targetscan进行靶基因预测。