高密度遗传图是如何辅助基因组组装的？

通过共线性分析，将遗传图谱上的标记与初步组装得到的scaffold进行比对，统计不同scaffold上的标记数目，得到不同连锁群上被锚定的scaffold信息，一个scaffold上如果锚定两个以上的标记，该scaffold的位置和方向均可以被定位到染色体水平。只有1个标记则只能定位到位置，方向不能确定。如果没有锚定到标记，则该scaffold仍然不能被定位到染色体水平，说明该scaffold多态性可能较差，需要构建更加精细的遗传图谱。