什么是eQTL，和基于DNA水平开发SNP的区别？

1）表达数量性状基因座（expression Quantitative Trait Loci,eQTL）是指的是染色体上一些能特定调控mRNA和蛋白质表达水平的区域，其mRNA/蛋白质的表达水平量与数量性状成比例关系，将各基因型的表达数据作为一个数量性状，利用传统的QTL分析方法进行分析。eQTL可分为顺式作用eQTL和反式作用eQTL，顺式作用eQTL就是某个基因的eQTL定位到该基因所在的基因组区域，表明可能是该基因本身的差别引起的mRNA水平变化；反式作用eQTL是指某个基因的eQTL定位到其他基因组区域，表明其他基因的差别控制该基因mRNA水平的差异。

2）基于转录组测序的关联分析是从SNP关联分析与GEM关联分析两个水平实现的，开发的SNP位于基因编码区域，SNP与基因(或Unigene)所属关系是已知，加上基因表达水平的关联分析就能够实现功能基因的精细定位。