测序结果中GO和KEGG富集分析所用的指标分别是KS和Q-value，一般文献用的都是p value<0.05，我想问一下KS和Q-value要分别设置为多少？有没有其他测序的文章用这两个指标。

答：Go富集我们使用的是Blast2GO R包;KEGG是我们根据fisher检验算法自己编写的程序。

KS<0.05,这个值和p-value的意义相同，是TopGO软件包中的一个检验方法。

Q-value<0.01，这个值是对p-value值的一个校正，和FDR概念相似，是fisher检验中的一个检验方法。

测序文章一般不用这两个指标，涉及到算法的文献中才有。