分类：
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1、从基因水平来开展对某（些）物种的研究是最直接、最有效、最易操作的途径，而通过转录组测序是获得基因的最为成熟的手段；
2、对于不同物种，尤其是无参考基因组或参考基因组不完善的同一科属内不同种的进化地位的确定，可通过直系同源基因来实现；
3、对于基因组很复杂，或者同一科属内物种差别大，无法通过重测序进行分析；
4、无需构建群体，研究对象为单独的物种。

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