医学circRNA测序

璀璨新星-circRNA

circRNA 在不同物种中具有保守性,而且存在组织表达差异,

可以作为竞争性内源RNA(ceRNA)结合miRNA,阻断miRNA 对靶基因的抑制作用,

具有开发疾病新型诊断与治疗方法的巨大潜力。

专业项目方案设计 深度解析数据

从选材到后续研究内容相关信息的挖掘,整个流程严谨进行,全程跟踪。

  • 实验设计

  • RNA提取

  • 建库测序

  • 数据分析

  • 售后答疑

样本要求

26

分析路线

27

个性化分析8小时云交付,项目进展透明化,尽享极致体验!

实时追踪项目进展,一切动向尽在掌握。

意见直接反馈项目经理,高效解决。

可对在线项目各维度的服务进行评价。

5

项目经验丰富,硕果累累

公司成立八年以来,拥有丰富的医学项目分析经验,累计完成5千多个样品的医学转录调控研究

医学物种涉及人、鼠,样本类型包括常见组织或细胞,以及体液、毛囊等特殊样本

公司拥有 40 余项专利技术和 150 余项软件著作权,根据项目需要选择最佳方案,保障结果精准

50+项目分析人员

深度数据挖掘

丰富的项目分析案例

优化的交互式报告

8年+项目分析经验

专业而热情的售后服务

三个分布式集群服务器

闪电般的分析速度

circRNA鉴定

基于环状数据库和软件鉴定,进行已知circRNA和新鉴定circRNA的区分,并给出相应的统计列表和数据库中已知circRNA的命名。

28
29

circRNA差异表达分析

针对是否有生物学重复,采用不同软件进行差异表达分析,通过火山图可以快速查看环状在不同样品中表达的差异性以及统计学显著性。

circRNA来源基因统计

在生物体内,不同的基因产物相互协调来行使生物学功能,对CircRNA来源基因的通路(Pathway)注释分析有助于进一步解读基因的功能。对CircRNA来源基因KEGG的注释结果按照KEGG中通路类型进行分类注释。

30
circRNA建库与其他RNA相比,有何不同?

对于circRNA,有2种建库方式,一种是去线性化,这种方式只可以得到circRNA的信息,因此,如果只集中研究circRNA,可以选择此种方式;另外一种是非去线性化,通过这种方式建库,可以同时获取mRNA、lncRNA和circRNA的信息。因此,关注更多RNA以及研究RNA相互关系,可以选择此种方式。

芯片circRNA研究与二代测序技术有什么区别?

由于目前对circRNA的研究相对较少,注释并不全面,由于芯片只能检测已知环状,因此会缺失许多新的circRNA信息以及大量特异表达的circRNA。二代测序技术通过软件进行环状RNA鉴定,既可以鉴定已知环状RNA,也可以预测新的环状RNA。因此,对于环状RNA研究而言,二代测序获取信息更全面。