分类: 转录组测序

受不同物种影响。

LD是不同基因座上等位基因非随机组合。但LD随世代的增加、重组次数的增加而不断下降。所以,那些繁殖力强、时代间隔短的物种(例如,昆虫),其LD衰减的速度是非常快的;同一物种,不同群体类型,由于其遗传背景不同,LD衰减速度也存在很大的差异。驯化群体,群体遗传多样性下降,位点间的相关性(连锁程度)加强。所以,驯化程度越高,选择强度越大的群体,LD衰减速越慢。同样,自然选择、遗传漂变导致的群体遗传多样性下降,也会减慢LD衰减的速度;染色体在不同位置的LD衰减距离是不同的。通常着丝粒区更难重组,所以LD衰减更慢,而基因组上那些受选择的区域相比普通的区域,LD衰减速度也是更慢的,因此分析结果提供了各个染色体独立的LD分析结果。

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