topGO富集中,显著性富集筛选标准KS值的全称是什么?KS的显著性意义是怎么统计出来的?KS是用什么软件统计的?
KS全称是:Kolmogorov-Smirnov,KS值是通过KS检验所得,KS检验是一种算法。统计方法如下:
- 首先计算每个go节点对应的gene个数,
2. 如果某个节点的子节点也有gene比对上,那么父节点对应的gene个数也要加上子节点的基因数
3. 使用KS统计检验进行p值的计算,文件中的KS值,就是老师常说的p value,叫KS值的原因,是体现使用的KS检验方法。
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