假设有一个基因A,测序结果中有一部分reads可以比对到3‘和5’端,中间的部分没有序列比对上,那么有什么办法可以延伸序列鉴定到中间部分的序列。

 分类:

答:(1)用实验的方法: 针对5’端和3’端的序列来设计引物,通过PCR实验进行延长和扩增.
(2)生信办法: 将该基因与它的近源物种做同源,如果能找到同源基因,则将该区域的所有read比对到同源基因上,进而来确定中间部分的序列。

最近文章

开始输入并按回车搜索