ITS 测序含义:ITS 是 internal transcribed spacer 的缩写,内部转录间隔区。
真核生物 rRNA 顺反子作为一个转录单元,包含 18S、5.8S 和 28S rRNA。转录后的剪接加工过程,会移除两个内部转录间隔区和 5.8SrRNA ,这两个内部转录间隔区和 5.8SrRNA 统称为 ITS 区。通常 18S rRN是作为真核生物分子鉴定的标准,但是 ITS 区在真菌分类里更加准确,要优于使用 18SrRNA作为标准得到的结果。
ITS1 和 ITS2 作为非编码区,承受的选择压力较小,相对变化较大,并且能够提供详尽的系统学分析所需要的可遗传性状。最近的研究发现,ITS1 比 ITS2 效率更高、引物适用性更普遍和广泛,此外 ITS1 的扩增片段更短、GC 含量更低,因此 ITS1 可能更优于 ITS2。
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