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 分类: 质谱检测

(1)定量准确性: iTRAQ/TMT的定量准确性和重现性要明显优于Label-free, Label-free的样本之间不能直接混合,导致定量的结果受到的影响因素多,因此定量结果的准确度较低;

(2)鉴定通量:Label-free通量相对较高,而iTRAQ/TMT由于标记基团的影响,鉴定通量较label-free低;

(3)修饰组学:label-free定量,修饰肽段的富集(即IP)是各组分开进行的,很可能造成富集的不平行,最终造成定量不准确。因此,我们通过加入内标肽段来归一化以减少富集步骤引入的误差。而iTRAQ/TMT标记的修饰组,修饰肽段的富集是各组标记、混合后同时进行的,所以不会存在富集的不平行。因此,修饰组的定量,iTRAQ/TMT方法的定量准确性优于label-free;

(4)其它:目前泛素化修饰定量组学只能用label-free来做。。

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