医学小RNA测序

精准剖析sRNA

Small RNA(主要包括miRNA、piRNA、siRNA)调控靶基因表达,

参与生长发育过程和疾病发生发展,小RNA 测序可快速鉴定出已知和未知的小RNA,

为研究小RNA 的功能及调控机制提供有力工具。

专业项目方案设计 深度解析数据

从选材到后续研究内容相关信息的挖掘,整个流程严谨进行,全程跟踪。

  • 实验设计

  • RNA提取

  • 建库测序

  • 数据分析

  • 售后答疑

样本要求

1

分析路线

3

个性化分析8小时云交付,项目进展透明化,尽享极致体验!

实时追踪项目进展,一切动向尽在掌握。

意见直接反馈项目经理,高效解决。

可对在线项目各维度的服务进行评价。

5

项目经验丰富,硕果累累

公司成立八年以来,拥有丰富的医学项目分析经验,累计完成5千多个样品的医学转录调控研究

医学物种涉及人、鼠,样本类型包括常见组织或细胞,以及体液、毛囊等特殊样本

公司拥有 40 余项专利技术和 150 余项软件著作权,根据项目需要选择最佳方案,保障结果精准

50+项目分析人员

深度数据挖掘

丰富的项目分析案例

优化的交互式报告

8年+项目分析经验

专业而热情的售后服务

三个分布式集群服务器

闪电般的分析速度

Small RNA筛选

由于Dicer酶和DCL酶的特异性,最终生成的成熟miRNA长度主要集中在20nt到24nt的范围内,动物的miRNA以22nt为主,通过软件分析鉴定出的已知miRNA和新miRNA。

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Small RNA碱基编辑分析

miRNA存在转录后碱基的编辑,导致种子序列(seed sequence)改变,进而使得作用的靶基因发生改变。

miRNA表达量总体分布

对各样本中已知和新miRNA进行表达量的统计,miRNA表达量总体分布图可以反映样品中miRNA的整体表达模式。

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差异miRNA靶基因通路富集分析

分析差异表达miRNA靶基因在某一通路上是否过出现(over-presentation)即为差异表达miRNA靶基因的Pathway富集分析。利用富集因子(Enrichment Factor)分析通路的富集程度,并利用Fisher精确检验方法计算富集显著性。

研究小RNA需要提供什么样品?

提供总RNA即可,针对小RNA测序,会有相应的片段筛选,进行片段选择之后,进行小RNA建库,建库采用针对小RNA进口试剂盒。

miRNA是如何鉴定的?

miRNA转录起始位点多位于基因间隔区、内含子以及编码序列的反向互补序列上,其前体具有标志性的发夹结构,成熟体的形成是由Dicer/DCL酶的剪切实现的。针对miRNA的生物特征,对于比对到参考基因组的序列,百迈客利用miRDeep2软件和小RNA数据库进行已知miRNA及新的miRNA预测。

miRNA测序不做生物学重复可以吗?

考虑到实验设计原则,建议做生物学重复。