外泌体RNA测序

液体活检的研究利器

外泌体(Exosome)是一种能被大多数细胞分泌的微小膜泡,分布于外周血、 尿液、 唾液、腹水、羊水等体液中。其来源多样,可来自各种类型细胞,其内容物含蛋白、脂质和核酸等,特别是在其中发现的non-coding RNA (miRNA、lncRNA、circRNA等) 使其更具有意义。外周血等体液中的分子标志物的检测具有无创伤、可重复特点,同时可于同一时间点进行多项指标的检测。通过高通量技术对外泌体RNA进行测序,可快速高效获得外泌体RNA的全面信息,是疾病诊断和随访的理想手段。目前基于外泌体进行RNA的研究主要集中在miRNA、lncRNA、circRNA、mRNA等类型上。

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应  用

lncRNA可以用作治疗耐药的潜在治疗靶标;

作为分子标志物用于疾病诊断、监测及预后;

lncRNAs富含miRNA种子序列,可研究癌变过程中其调控机理等;

外泌体介导的ncRNA的转运对于细胞功能的调节作用;

外泌体ncRNA介导的肿瘤发生、发展机理研究;

miRNA与circRNA互作,在肿瘤等疾病发生发展中的调控作用等。

研究热点

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科学合理方案设计

从取样方案,建库测序,到分析策略,根据研究目的量身设计,定制您专属的最佳方案。

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项目经验,科研实力

1. 强大的科研实力:

国内首家推出低起始量建库策略,小RNA建库起始只需2ng,在确保结果准确的同时解决了体液样本因量低研究困难的科学问题;

2.丰富的项目经验:

目前已拥有上百个项目经验,涉及体液样本类型丰富,包括血浆、血清、细胞上清、尿液、乳汁、灌洗液、精液、唾液等;

3.专业的科研团队:

国内唯一一家拥有独立的外泌体RNA测序研究团队;根据研究需求,量身定制,免费提供最优的项目方案。

4种lncRNA鉴定方法

lncRNA不编码蛋白,通过对转录本进行编码潜能筛选,判断其是否具有编码潜能,从而可以判定该转录本是否为lncRNA。百迈客综合目前应用最广泛的编码潜能分析方法对以上候选lncRNA进行进一步的筛选,主要包括:CPC分析、CNCI分析、CPAT分析、pfam蛋白结构域分析四种方法,取其并集筛选可靠地lncRNA。

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差异表达lncRNA聚类热图

基于所有差异表达的lncRNA进行聚类图分析,不仅可以直观的反应出各样本的表达模式,还可以对于不同组合的样本重复性进行检测,筛选特异性表达的lncRNA。

miRNA碱基编辑

miRNA存在转录后碱基的编辑,导致种子序列(seed sequence)改变,进而使得作用的靶基因发生改变,百迈客使用isomiRID软件检测发生碱基编辑的miRNA。通过miRNA碱基编辑分析可以深入研究miRNA,并可有效识别真正的功能miRNA

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提取外泌体时,选择血清还是血浆?

目前基于文献查阅发现,基于血浆进行外泌体RNA研究的更多。由于血液样本处理时,血小板凝血过程中会分泌大量的外泌体到血清中,所以目前如果不是研究血小板相关的疾病,建议可以选择血浆样本。针对于不同的研究目的我们可以根据实际需求进行选择。

如果送新鲜的血液样本,那么抗凝剂应该加什么?

我们推荐的采血管都是自带抗凝剂的,STECK的比较好,建议老师采血后数小h内完成血浆分离,液氮速冻3-5h,后干冰运输。

送血浆样本,那么应该在几小时内立即分离出血浆?

建议老师尽快处理,搜集后4度保存,全血不能冻,建议尽量1h内完成血浆的分离。

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