外泌体(Exosome)是一种能被大多数细胞分泌的微小膜泡,分布于外周血、 尿液、 唾液、腹水、羊水等体液中。其来源多样,可来自各种类型细胞,其内容物含蛋白、脂质和核酸等,特别是在其中发现的non-coding RNA (miRNA、lncRNA、circRNA等) 使其更具有意义。外周血等体液中的分子标志物的检测具有无创伤、可重复特点,同时可于同一时间点进行多项指标的检测。通过高通量技术对外泌体RNA进行测序,可快速高效获得外泌体RNA的全面信息,是疾病诊断和随访的理想手段。目前基于外泌体进行RNA的研究主要集中在miRNA、lncRNA、circRNA、mRNA等类型上。
从取样方案,建库测序,到分析策略,根据研究目的量身设计,定制您的专属方案。
lncRNA不编码蛋白,通过对转录本进行编码潜能筛选,判断其是否具有编码潜能,从而可以判定该转录本是否为lncRNA。百迈客综合目前应用最广泛的编码潜能分析方法对以上候选lncRNA进行进一步的筛选,主要包括:CPC分析、CNCI分析、CPAT分析、pfam蛋白结构域分析四种方法,取其并集筛选可靠地lncRNA。
基于所有差异表达的lncRNA进行聚类图分析,不仅可以直观的反应出各样本的表达模式,还可以对于不同组合的样本重复性进行检测,筛选特异性表达的lncRNA。
miRNA存在转录后碱基的编辑,导致种子序列(seed sequence)改变,进而使得作用的靶基因发生改变,百迈客使用isomiRID软件检测发生碱基编辑的miRNA。通过miRNA碱基编辑分析可以深入研究miRNA,并可有效识别真正的功能miRNA
目前基于文献查阅发现,基于血浆进行外泌体RNA研究的更多。由于血液样本处理时,血小板凝血过程中会分泌大量的外泌体到血清中,所以目前如果不是研究血小板相关的疾病,建议可以选择血浆样本。针对于不同的研究目的我们可以根据实际需求进行选择。
我们推荐的采血管都是自带抗凝剂的,STECK的比较好,建议老师采血后数小h内完成血浆分离,液氮速冻3-5h,后干冰运输。
建议老师尽快处理,搜集后4度保存,全血不能冻,建议尽量1h内完成血浆的分离。