百迈客生物云平台利用先进的云计算技术,全新的教育信息化理念,倾心打造生物信息学习平台。百迈客培训班的内容涵盖多个方向,包括转录组、Small RNA、重测序、微生物多样性等生物信息热点研究方向。授课讲师均为一线资深分析工程师。拥有大量生物信息项目分析经验和实践经验,可以结合项目实例来讲解分析思路以及分析方法,能够全面满足学员的各种需求。

专题列表

 

转录组专题 microRNA专题 Reseq专题 微生物多样性专题

二代测序数据介绍

质量控制介绍

数据对比分析

转录组测序原理介绍

转录组研究重要性

转录调控、疾病分型、分析标记物介绍

转录组研究方法比较

数据分析流程详解

差异表达分析

从转录组数据发现SNPs

RNA-seq鉴定SNP的优缺点

RNA-seq分析SNP流程详解及上机操作

从转录组数据预测IncRNAs

lncRNA调控机制

转录组学技术应用案例

使用DAVID进行功能分析

microRNA目前的应用、发展历史以及microRNA的定义

microRNA的生物学过程

microRNA的测序

microRNA测序数据分析软件

microRNA目前的挑战以及将来的研究前景

microRNA测序数据分析案例展示

microRNA测序数据预处理

测序数据长度分布计算

microRNA的预测

microRNA碱基偏好性计算

microRNA靶标基因预测,结果提取、统计

基因组重测序的概念、目的与应用

对二代测序数据的解读

数据质量控制及数据过滤

使用BWA和Samtools进行数据比对并对比对结果进行可视化

寻找SNP和Indel并进行注释

寻找结构变异并对变异进行注释

生物信息学数据库及、公共资源应用GenBank、RefSeq、UniProt、Ensembl、PDB等;

群体遗传学理论:

进化分析;

GWAS分析;

16S、18S rRNA 基因、ITS、 功能基因分析

微生物群落的 R 语言高级分析

单菌株基因组和转录组分析

环境样品基因组/转录组分析

扩增子测序分析流程设计

PE Reads拼接和质控

OTU聚类

物种注释和数据库介绍

物种组成及其丰度分析

Alpha多样性分析

Beta多样性分析

Qiime pipeline的安装

降维图和群落差异性分析

坏境因子关联分析

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