百迈客云sRNA测序分析平台适用于sRNA测序数据的分析,分析内容包括基本分析和数据挖掘(miRNA挖掘、miRNA差异表达挖掘)两个部分。

    sRNA测序分析平台基本分析只需进行原始数据导入、参考基因组选择、差异分组选择等操作,即可完成任务提交。分析内容全面与常规交付公司的分析内容一致,包括数据质控、sRNA分类注释、microRNA分析、microRNA靶基因分析等,分析结果准确可靠,以结题报告的形式展示。

    miRNA挖掘板块包括目标miRNA检索及miRNA维恩图绘制两部分。

    miRNA检索支持四种筛选方式:miRNA ID、miRNA序列、靶基因ID、靶基因功能,用户可以从大量的表达miRNA中快速准确的筛选出感兴趣的miRNA及其靶基因,针对筛选出的miRNA可以进行miRNA表达聚类分析、碱基偏好性分析、基因家族分析及其靶基因功能分析等。

    通过miRNA维恩图绘制用户可快速得到样本间特有及共有表达miRNA,如组织特异表达miRNA筛选、不同胁迫处理样品间特异表达miRNA筛选、不同发育时期特异表达miRNA筛选等,并对特定miRNA进行后续分析。

    miRNA差异表达挖掘可分为差异表达miRNA集查询、差异表达miRNA集维恩图、miRNA共表达趋势分析三个部分。

    差异表达miRNA集查询可实现特定样本间差异表达miRNA的筛选,并对筛选得到的miRNA进行二次排序筛选、表达量聚类图绘制、碱基偏好性分析、长度统计、表达量柱状图绘制,也可对其靶基因进行COG分类图、GO分类图、KEGG通路图绘制等;

    差异表达miRNA集维恩图实现不同的样品之间特异及共有差异表达miRNA筛选,并对筛选得到的目标miRNA可进行二次排序筛选、表达量聚类图绘制、碱基偏好性分析、长度统计、表达量分析及其靶基因功能分类;

    miRNA共表达趋势分析可实现相似表达模式miRNA的聚类分析,并绘制出表达趋势图。

Copyright © 2009-2016 北京百迈客生物科技有限公司版权所有 京ICP备10042835号
公司地址:北京市顺义区南法信府前街12号顺捷大厦5层
Tel:400-600-3186; Fax:010-57045001 E-mail:tech@biomarker.com.cn