宏转录组学是一门在整体水平上研究某一特定环境、特定时期群体生物全基因组转录情况以及转录调控规律的学科。宏转录组测序可原位研究特定生境特定时空下微生物群落中活跃菌种的组成以及活性基因的表达情况。结合理化因素的检测,宏转录组可研究多样本间由于理化等指标的差异,时空上不同微生物群落间活跃成分组成的差异分析。

样品类型:总RNA;

样品浓度:≥65 ng/μl;

样品体积:≥10μl;

样品总量:>6μg;

样品纯度:OD260/280≥1.8,OD260/230≥0.5,260nm处有正常峰值;

RNA完整性:RIN≥7.0;23S/16S≥1.0;无基因组DNA污染。

羊瘤胃微生物宏转录组研究产甲烷差异原因

   羊作为反刍动物一种,其所排放的甲烷是温室气体的重要来源之一,但经过观察发现在不同羊个体之间存对于排放甲烷气体存在着明显的差异,本篇文献通过对羊瘤胃微生物进行宏转录组研究,找出产甲烷代谢过程中所有表达上调和下调的基因,来阐述产甲烷差异原因。

 

 

 

产甲烷代谢通路

 

参考文献:Shi, W., et al., Methane yield phenotypes linked to differential gene expression in the sheep rumen microbiome.Genome Res, 2014. 24(9): p. 1517-25.

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