百迈客引进最为先进的三代测序系统以及光学系统应用于真菌基因组的测序研究,根据不同的研究需求,采用多种平台结合可为您提供真菌基因组调研图、超精细图以及准完成图的测序技术。

 

 

1、样品类型:真菌DNA样品;

2、样品浓度:调研图≥30ng/μl,超精细/准完成图≥20ng/μl;

3、样品总量:调研图≥2μg,超精细/准完成图≥15μg 。

三代测序结合光学图谱对真菌基因组进行完整组装

   新一代测序技术快速发展,广泛用于基因组的研究。然而对于复杂的真菌基因组组装还存在一定的难度。随着三代测序技术的推出与成熟,已越来越多的用于真菌基因组的测序组装,本篇文章对丝状真菌轮枝菌采用多种测序手段与策略进行了组装评估,比较Illumina测序的组装效果,单独用Pacbio测序长片段的组装效果以及PacBio与光学图谱联合组装的效果,研究发现,三代测序与光学图谱联合组装获得了八条轮枝菌的染色体完整基因组,该文章证明可通过PacBio测序的长片段与光学图谱进行联合组装可以研究原先组装较差或者无法组装的真菌基因组进行深层次的研究,并可以讲真菌基因组组装到近染色体的水平

 

 

 

注:不同测序策略组装结果比较

 

参考文献: Faino L. et al. 2015. Single-molecule real-time sequencing combined with optical mapping yields completely finished fungal genome. mBio 6(4):e00936-15.

 

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