对于细菌基因研究,百迈客采用最为先进的Pacbio三代测序平台进行测序,对细菌基因组进行拼接、组装,获得完整细菌基因组图谱。完成细菌基因组测序及后续的信息分析。细菌基因组研究不仅有利于研究细菌的基本生命过程, 同时也对高等真核生物的基因组学及后基因组学研究提供了参考。

1、样品类型:细菌DNA样品;

2、样品浓度:完成图≥20ng/μl;

3、样品总量:完成图≥15ng/μl。

三代测序研究结合杆菌抗药性进化原因 

   抗生素抗性杆菌(CRE)严重威胁着全球人类的健康,抗生素抗性杆菌对市面上已有的抗生素都不敏感,是一种广谱抗生素抗性的细菌。该文章采用单分子实时测序技术(SMRT),获得了抗生素抗性杆菌的完整基因组信息,并精确定位到了抗生素抗性元件,包括带有OXA-181碳青霉烯霉的基因的转座元件。很有趣的是,同时发现了ISEcp1-blaOXA-181移动元件的三个拷贝,其中的一个拷贝元件可以破坏mgrB的调节基因,从而对粘菌素(治疗胃炎药物)产生抗药性。该研究在基因水平描述了广谱抗药性杆菌的基因组信息,揭示了这些移动的抗药性元件在促进细菌耐药性出现的关键作用。

 

 

耐药性基因转座元件在染色体上的位置

 

参考文献: Hosam M. Zowawi et al. Stepwise evolution of pandrugresistance in Klebsiella pneumoniae scientific Reports DOI: 10.1038(2015)

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